191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2239 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  100 
 
 
112 aa  233  9e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  82.14 
 
 
112 aa  201  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  80.36 
 
 
112 aa  197  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  81.08 
 
 
112 aa  197  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  76.79 
 
 
112 aa  183  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  75.68 
 
 
112 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  72.57 
 
 
113 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  74.77 
 
 
112 aa  177  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.45 
 
 
113 aa  176  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.45 
 
 
120 aa  176  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  73.45 
 
 
120 aa  176  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  73.45 
 
 
120 aa  176  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.45 
 
 
113 aa  176  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.45 
 
 
113 aa  176  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.45 
 
 
113 aa  176  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.45 
 
 
113 aa  176  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.45 
 
 
113 aa  176  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  75.68 
 
 
124 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  72.32 
 
 
112 aa  176  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  75.68 
 
 
124 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  71.68 
 
 
122 aa  175  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  73.45 
 
 
113 aa  173  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  73.45 
 
 
113 aa  173  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  72.57 
 
 
113 aa  173  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.21 
 
 
113 aa  172  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.87 
 
 
110 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  72.32 
 
 
130 aa  170  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  68.14 
 
 
113 aa  168  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  75.22 
 
 
112 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  73.04 
 
 
113 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1791  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.86 
 
 
112 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  68.81 
 
 
111 aa  164  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.86 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  65.18 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  68.75 
 
 
113 aa  164  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  69.91 
 
 
113 aa  164  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  66.96 
 
 
112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  71.3 
 
 
113 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  72.32 
 
 
112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  66.07 
 
 
112 aa  163  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  66.07 
 
 
112 aa  163  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  72.57 
 
 
113 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  66.96 
 
 
113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  68.7 
 
 
113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.86 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  68.52 
 
 
111 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  65.49 
 
 
113 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  69.03 
 
 
114 aa  161  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.59 
 
 
137 aa  160  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.59 
 
 
137 aa  160  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.914109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  67.59 
 
 
111 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.59 
 
 
111 aa  159  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  67.59 
 
 
111 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  65.74 
 
 
111 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  65.74 
 
 
111 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  67.59 
 
 
111 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  67.59 
 
 
111 aa  159  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  67.59 
 
 
111 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  65.74 
 
 
111 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  65.74 
 
 
111 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  65.74 
 
 
111 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  67.59 
 
 
111 aa  159  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  66.67 
 
 
112 aa  157  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0976  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  66.96 
 
 
113 aa  157  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3334  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  66.96 
 
 
113 aa  157  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.72 
 
 
113 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  65.49 
 
 
113 aa  156  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  65.49 
 
 
113 aa  155  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  65.49 
 
 
113 aa  155  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  65.49 
 
 
113 aa  155  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4283  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  62.83 
 
 
113 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  64.29 
 
 
113 aa  154  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1540  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.72 
 
 
113 aa  154  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.776148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.67 
 
 
134 aa  154  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  67.57 
 
 
114 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.72 
 
 
113 aa  153  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.39 
 
 
113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0904  PhnA-like protein  67.59 
 
 
109 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000773889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0946  phnA protein  69.44 
 
 
109 aa  151  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000317474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2382  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  64.86 
 
 
116 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00334109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30650  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  62.83 
 
 
121 aa  148  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0433  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  66.07 
 
 
112 aa  147  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1818  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.18 
 
 
113 aa  147  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942108  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2159  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.18 
 
 
113 aa  147  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.3 
 
 
112 aa  144  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4739  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  62.73 
 
 
114 aa  143  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191551  normal  0.436041 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3770  hypothetical protein  63.89 
 
 
113 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0160  PhnA protein  62.07 
 
 
117 aa  141  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.542327  hitchhiker  0.0000205972 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0170  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  62.07 
 
 
117 aa  140  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.747936  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0322  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.4 
 
 
116 aa  140  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0378499  hitchhiker  0.00000000814869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0340  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.8 
 
 
113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2533  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.55 
 
 
113 aa  138  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3090  putative alkylphosphonate uptake protein, phnA  60.19 
 
 
109 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3817  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.63 
 
 
112 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1248  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.56 
 
 
113 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1092  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.33 
 
 
114 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1931  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.41 
 
 
114 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00764196  normal  0.0125839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  57.02 
 
 
114 aa  133  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1233  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.41 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1165  alkylphosphonate uptake protein  52.21 
 
 
108 aa  122  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>