177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0626 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  68.62 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.55 
 
 		 185 aa  265  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  60.85 
 
 		 191 aa  248  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  50 
 
 		 189 aa  198  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  50.53 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  49.46 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  47.85 
 
 		 192 aa  188  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  47.92 
 
 		 195 aa  185  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  50 
 
 		 187 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  48.4 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  50 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  50 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  48.4 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  47.87 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  47.87 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  47.87 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  47.87 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  47.09 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  42.35 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  47.67 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  43.3 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  40.96 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  44.39 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  43.39 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  37.06 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  37.89 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  48.48 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  43.01 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  47.76 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  47.76 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  47.76 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  47.76 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1830  PhnA protein  40.4 
 
 		 101 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0790585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  42.65 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  44.12 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  43.94 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  42.65 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  41.46 
 
 		 112 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  45.45 
 
 		 101 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.21 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  41.79 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  40.91 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  39.39 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  41.1 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.78 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  42.42 
 
 		 114 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  33.96 
 
 		 134 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3770  hypothetical protein  35.42 
 
 		 113 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  39.39 
 
 		 73 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.37 
 
 		 112 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.66 
 
 		 112 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0904  PhnA-like protein  36.36 
 
 		 109 aa  53.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000773889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.29 
 
 		 112 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  34.65 
 
 		 112 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  41.18 
 
 		 114 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.25 
 
 		 113 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1298  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.78 
 
 		 112 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.25 
 
 		 113 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.25 
 
 		 113 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.25 
 
 		 113 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.25 
 
 		 113 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.46 
 
 		 112 aa  52.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.75 
 
 		 110 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01751  hypothetical protein  40.86 
 
 		 111 aa  52  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.14 
 
 		 113 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.14 
 
 		 120 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  37.14 
 
 		 120 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  37.14 
 
 		 120 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1752  hypothetical protein  26.92 
 
 		 125 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  40.91 
 
 		 73 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.94 
 
 		 113 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  42.42 
 
 		 71 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  34.07 
 
 		 112 aa  51.6  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  34.62 
 
 		 111 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  38.04 
 
 		 113 aa  51.2  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  43.94 
 
 		 122 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  35.87 
 
 		 113 aa  51.2  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.37 
 
 		 112 aa  51.2  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  36.56 
 
 		 113 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  38.95 
 
 		 113 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.71 
 
 		 113 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  35.48 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.42 
 
 		 113 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2838  hypothetical protein  24.53 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.8 
 
 		 112 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.76 
 
 		 113 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0570  hypothetical protein  26.21 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2465  hypothetical protein  27.62 
 
 		 125 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000067501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.78 
 
 		 111 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0433  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.08 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0946  phnA protein  44.62 
 
 		 109 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000317474  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  52.27 
 
 		 69 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.42 
 
 		 113 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5170  PhnA-like protein  37.5 
 
 		 102 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00732124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.91 
 
 		 112 aa  50.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  36.14 
 
 		 113 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2670  hypothetical protein  24.53 
 
 		 125 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.847903 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  36.26 
 
 		 111 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>