199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04990 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  69.27 
 
 		 192 aa  275  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  59.46 
 
 		 190 aa  240  7e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  57.81 
 
 		 189 aa  226  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  54.84 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  56.02 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  56.02 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  56.02 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  56.02 
 
 		 187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  56.02 
 
 		 187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  57.07 
 
 		 189 aa  211  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  57.14 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  53.72 
 
 		 192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  56.08 
 
 		 187 aa  207  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  56.08 
 
 		 187 aa  207  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  52.85 
 
 		 195 aa  206  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  55.56 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  51.31 
 
 		 189 aa  194  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  49.74 
 
 		 184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  48.96 
 
 		 192 aa  188  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  51.91 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  49.48 
 
 		 191 aa  180  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  46.03 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  47.4 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.35 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  42.35 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  40.1 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.67 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.37 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  52.24 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.53 
 
 		 113 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  50.75 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.32 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  49.25 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.32 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.32 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  43.82 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  44.12 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.61 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  49.25 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  45.59 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  43.18 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0322  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.19 
 
 		 116 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0378499  hitchhiker  0.00000000814869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.5 
 
 		 112 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  47.89 
 
 		 112 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  47.89 
 
 		 112 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.32 
 
 		 113 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  45.59 
 
 		 69 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  51.47 
 
 		 72 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.16 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  44.12 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1540  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.776148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.71 
 
 		 112 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.19 
 
 		 118 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  50 
 
 		 114 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6268  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.19 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940336  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7062  PhnA protein  42.53 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225206  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.02 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  45.83 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1254  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0192046  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.02 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.61 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.22 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6556  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.22 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0933451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6162  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.22 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  40.91 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  40.43 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.43 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  40.43 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  40.43 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  29.41 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  29.41 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  40.43 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01751  hypothetical protein  49.3 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  40.43 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  40.43 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.45 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  40.91 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  39.36 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  39.36 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  39.36 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  39.36 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.21 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  39.36 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  45.24 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.34 
 
 		 113 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  35.42 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0482  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.76 
 
 		 134 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  43.24 
 
 		 101 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 112 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.19 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.29 
 
 		 112 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.29 
 
 		 112 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1165  alkylphosphonate uptake protein  41.89 
 
 		 108 aa  53.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.48 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3011  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.76 
 
 		 114 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2082  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.76 
 
 		 114 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0286  phnA family protein  47.76 
 
 		 114 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0298  phnA family protein  47.76 
 
 		 114 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>