195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1443 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  100 
 
 
192 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  91.15 
 
 
192 aa  370  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  68.85 
 
 
187 aa  272  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  68.85 
 
 
187 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  68.85 
 
 
187 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  68.31 
 
 
187 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  68.31 
 
 
187 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  69.4 
 
 
187 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  68.31 
 
 
187 aa  263  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  68.31 
 
 
187 aa  263  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  68.31 
 
 
187 aa  263  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  60.87 
 
 
189 aa  246  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  63.3 
 
 
188 aa  239  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  65.41 
 
 
189 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  53.4 
 
 
195 aa  221  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  52.69 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  53.72 
 
 
192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  52.72 
 
 
191 aa  204  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  52.11 
 
 
192 aa  202  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  52.38 
 
 
190 aa  197  7e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  47.85 
 
 
188 aa  188  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  52.17 
 
 
184 aa  185  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  49.71 
 
 
185 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.12 
 
 
185 aa  178  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  47.09 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  45.16 
 
 
192 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  38.83 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  59.09 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  50.72 
 
 
72 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  50.72 
 
 
72 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  53.03 
 
 
69 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.39 
 
 
111 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  47.83 
 
 
72 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  48.48 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.4 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  49.25 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  55.88 
 
 
73 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  50.75 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  55.88 
 
 
73 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.78 
 
 
113 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  50.75 
 
 
69 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  41.94 
 
 
112 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  41.94 
 
 
112 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2844  PhnA protein  48.48 
 
 
70 aa  62.8  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  48.48 
 
 
101 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  49.25 
 
 
69 aa  62  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  51.47 
 
 
73 aa  62  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6162  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 
117 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 
117 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6556  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 
117 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0933451  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  48.48 
 
 
131 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  60.42 
 
 
69 aa  60.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  39 
 
 
114 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.13 
 
 
113 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  36.36 
 
 
112 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.13 
 
 
113 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.04 
 
 
115 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  38.04 
 
 
113 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  45.59 
 
 
101 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  52.24 
 
 
71 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7062  PhnA protein  41.67 
 
 
118 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225206  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  49.23 
 
 
101 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.51 
 
 
113 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  38.64 
 
 
99 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 
118 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.42 
 
 
114 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6268  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 
114 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940336  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.93 
 
 
99 aa  58.2  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  46.97 
 
 
101 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  46.97 
 
 
101 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  52.24 
 
 
73 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  36.17 
 
 
124 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  35.92 
 
 
113 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  36.96 
 
 
113 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.46 
 
 
113 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.46 
 
 
113 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.04 
 
 
112 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  38.3 
 
 
122 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  44.62 
 
 
101 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.8 
 
 
112 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.8 
 
 
112 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  42.25 
 
 
102 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  35.48 
 
 
113 aa  55.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.95 
 
 
112 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.05 
 
 
113 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.23 
 
 
113 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.23 
 
 
113 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  37.23 
 
 
113 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3342  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  39.68 
 
 
114 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0257  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.68 
 
 
114 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1165  alkylphosphonate uptake protein  38.27 
 
 
108 aa  54.7  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3011  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.68 
 
 
114 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2082  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.68 
 
 
114 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1138  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.46 
 
 
92 aa  54.7  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0286  phnA family protein  39.68 
 
 
114 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0298  phnA family protein  39.68 
 
 
114 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3336  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.68 
 
 
114 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5170  PhnA-like protein  34.38 
 
 
102 aa  54.7  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00732124  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0482  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.68 
 
 
134 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.74 
 
 
110 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>