192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0481 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  64.55 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  60.85 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.49 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  52.72 
 
 		 192 aa  204  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  53.26 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  54.17 
 
 		 192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  51.05 
 
 		 189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  49.74 
 
 		 195 aa  194  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  49.74 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  50.26 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  49.74 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  46.03 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  49.74 
 
 		 187 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  49.74 
 
 		 187 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  49.46 
 
 		 190 aa  181  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  48.15 
 
 		 187 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  49.48 
 
 		 192 aa  180  9.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  48.15 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  48.15 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  47.09 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  49.46 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  51.58 
 
 		 189 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  45.79 
 
 		 191 aa  166  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  41.8 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  41.97 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  37.37 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  47.06 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  45.59 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  48.48 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  44.12 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  44.62 
 
 		 69 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.34 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  43.9 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.34 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  43.94 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.86 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.78 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.96 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  44.87 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1830  PhnA protein  40.21 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0790585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  40.3 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  54.17 
 
 		 69 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  45.45 
 
 		 101 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.48 
 
 		 113 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  40.3 
 
 		 69 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  36.56 
 
 		 113 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  39.13 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.48 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.87 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  43.94 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  48.65 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  44.44 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  45.21 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  55.32 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.48 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  46.97 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  40.3 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.66 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  35.71 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.59 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  54.17 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  43.28 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.94 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.94 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.76 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.76 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.86 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  40.3 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  43.28 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  43.28 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1254  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.48 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0192046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  54.17 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  40.96 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  41.76 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.76 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  48.48 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  40.24 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  41.76 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  41.76 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  41.76 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  41.76 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  41.76 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  46.43 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  42.47 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  42.47 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.83 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.31 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.31 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.31 
 
 		 120 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  42.31 
 
 		 120 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.15 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.31 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.31 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.56 
 
 		 134 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>