70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5171 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  100 
 
 		 187 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  41.62 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  42.02 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  41.05 
 
 		 192 aa  148  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  42.62 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  40.1 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  38.17 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  40.43 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  36.32 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  38.83 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  40.76 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  39.46 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  39.46 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  39.46 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  39.46 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  39.46 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  39.47 
 
 		 195 aa  130  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  38.92 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  38.92 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  38.92 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  38.38 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  39.25 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  33.15 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  33.15 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  37.89 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  37.37 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  35.45 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  40.91 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.65 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.18 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  39.71 
 
 		 72 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  39.71 
 
 		 72 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  35.16 
 
 		 101 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  38.24 
 
 		 72 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  38.2 
 
 		 99 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  35.42 
 
 		 101 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  40.91 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  35.42 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  35.42 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  36.23 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  38.36 
 
 		 73 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  36.23 
 
 		 69 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  36.56 
 
 		 101 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  35.29 
 
 		 72 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  36.23 
 
 		 69 aa  45.1  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  29.13 
 
 		 112 aa  44.7  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  34.33 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  44.07 
 
 		 69 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.71 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  34.78 
 
 		 69 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3747  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  31.88 
 
 		 118 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  34.33 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.3 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  33.33 
 
 		 113 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  29.7 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  37.31 
 
 		 131 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  36.76 
 
 		 70 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  37.68 
 
 		 102 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  36.76 
 
 		 73 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  33.33 
 
 		 113 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  34.85 
 
 		 114 aa  42  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  37.84 
 
 		 73 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  29.81 
 
 		 113 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  35.53 
 
 		 114 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  36.23 
 
 		 99 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  31.94 
 
 		 71 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  34.25 
 
 		 73 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  35.23 
 
 		 130 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  51.22 
 
 		 112 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  51.22 
 
 		 112 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>