194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2128 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  54.21 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  49.21 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  47.62 
 
 		 190 aa  181  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  48.15 
 
 		 189 aa  178  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  46.03 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  46.84 
 
 		 195 aa  175  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  48.15 
 
 		 192 aa  175  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  47.09 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  47.8 
 
 		 189 aa  168  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  45.79 
 
 		 191 aa  166  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  44.97 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  44.74 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  43.92 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  43.92 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  43.92 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.88 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  45.5 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  41.88 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  48.09 
 
 		 188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  39.89 
 
 		 189 aa  154  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  44.97 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  44.97 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  44.97 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  44.39 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  42.86 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  42.62 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.2 
 
 		 111 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.24 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.16 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6268  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.68 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940336  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.68 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.87 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.87 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.05 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.05 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  50 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.46 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6556  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.46 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0933451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6162  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.46 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.34 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.24 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  35.64 
 
 		 113 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7062  PhnA protein  41.46 
 
 		 118 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225206  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.05 
 
 		 112 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.46 
 
 		 113 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  36 
 
 		 115 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.16 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  41.67 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  41.67 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  40.48 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.86 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.16 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.05 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  40.48 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.16 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  44.58 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.12 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.12 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.72 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  42.55 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.24 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1752  hypothetical protein  31.58 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  42.55 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  42.55 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  42.55 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  42.55 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  41.67 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.72 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  40.48 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2465  hypothetical protein  31.58 
 
 		 125 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000067501  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  41.33 
 
 		 113 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.48 
 
 		 112 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.04 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  39.29 
 
 		 112 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.14 
 
 		 110 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  42.65 
 
 		 113 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  40.48 
 
 		 111 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  45.57 
 
 		 113 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.48 
 
 		 112 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.29 
 
 		 112 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  45.57 
 
 		 113 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4283  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.93 
 
 		 113 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>