189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2006 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  100 
 
 
73 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  97.26 
 
 
73 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  84.93 
 
 
73 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  82.61 
 
 
69 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  76.47 
 
 
70 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  75.34 
 
 
71 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  69.01 
 
 
72 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  67.61 
 
 
72 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  66.2 
 
 
72 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  58.57 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  65.15 
 
 
131 aa  90.9  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  64.29 
 
 
72 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2844  PhnA protein  69.12 
 
 
70 aa  90.1  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  60 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  61.19 
 
 
99 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  59.7 
 
 
101 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  59.7 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  59.7 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  64.18 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  60 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1830  PhnA protein  58.21 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0790585  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  59.7 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  64.71 
 
 
73 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  58.82 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  52.78 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  58.82 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.75 
 
 
111 aa  76.6  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  58.82 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5170  PhnA-like protein  52.17 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00732124  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  59.42 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  61.76 
 
 
69 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.14 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  59.09 
 
 
69 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.78 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.78 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.52 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.57 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  55.07 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  55.07 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0240  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.67 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.86 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.07 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  57.35 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1254  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.43 
 
 
79 aa  73.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0192046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  55.71 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.71 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.07 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.71 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.07 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.07 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  55.07 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  55.07 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.07 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.07 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  59.72 
 
 
189 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.07 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  55.71 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.88 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.07 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.07 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1028  hypothetical protein  52.94 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000970664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  55.71 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  55.71 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.71 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  55.71 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  55.71 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  50.72 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1138  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.71 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4283  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.17 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0976  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.07 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.86 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  52.86 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  54.29 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  54.29 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  54.29 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.62 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3334  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.07 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  54.29 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  54.29 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.86 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0946  phnA protein  53.62 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000317474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3747  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.71 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.41 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.62 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.72 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.57 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  59.09 
 
 
195 aa  70.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.17 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.41 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.72 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.94 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1344  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.62 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.204916  normal  0.319142 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  52.17 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  53.62 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.94 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.88 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1165  alkylphosphonate uptake protein  55.71 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.88 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6162  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.88 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0784231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>