189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5170 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5170  PhnA-like protein  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00732124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1830  PhnA protein  69.61 
 
 		 101 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0790585  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  73 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  70.71 
 
 		 99 aa  141  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  65.35 
 
 		 101 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  63.73 
 
 		 99 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  61.76 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  61.76 
 
 		 101 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  61.76 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  64.29 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  61.76 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  65.66 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  59.42 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  60.87 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  58.21 
 
 		 73 aa  84.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  43.62 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  43.62 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  58.82 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.75 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.49 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.76 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1791  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  42.31 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.31 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.84 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  56.25 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  44.33 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  41.51 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  55.71 
 
 		 72 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  38.68 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  42.31 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  42.31 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  53.62 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  42.31 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  42.31 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.43 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.84 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  42.31 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  41.35 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  40.57 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  41.35 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.71 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  54.29 
 
 		 72 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  41.35 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  41.35 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.55 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  41.35 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  41.51 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  39.8 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  41.51 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3770  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  55.07 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.67 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  37.74 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  55.71 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.43 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.81 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  43.75 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.68 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  47.83 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.3 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.22 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.74 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.62 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  40 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  52.17 
 
 		 73 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  36.79 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.7 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.01 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  49.25 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.71 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  40.95 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.68 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  42.22 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  38.68 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4739  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.11 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191551  normal  0.436041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.22 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.22 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.36 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  44.09 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3817  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.78 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.94 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0322  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.94 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0378499  hitchhiker  0.00000000814869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  41.67 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  41.67 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.42 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3090  putative alkylphosphonate uptake protein, phnA  43.84 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.58 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.75 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  38.68 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>