38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4120 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  100 
 
 		 256 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  92.58 
 
 		 256 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  61.07 
 
 		 282 aa  288  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  55.81 
 
 		 269 aa  261  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  52.63 
 
 		 263 aa  250  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  51.59 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  53.07 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  53.85 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  53.41 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  52 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  53.72 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  51.24 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  52.46 
 
 		 286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  48.8 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  51.27 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  51.91 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  55.46 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  49.44 
 
 		 295 aa  202  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  49.6 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  53.94 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  46.18 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  47.2 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  47.06 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  45.12 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  46.53 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  44.72 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  44.58 
 
 		 241 aa  168  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  44.08 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  48.37 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  46.34 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  46.34 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  46.64 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  46.64 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  44.18 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  37.63 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  24.53 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  34.44 
 
 		 360 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  29.63 
 
 		 210 aa  42.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>