166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1937 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1937  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  333  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  68.48 
 
 
445 aa  225  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1302  IS4 family transposase  63.19 
 
 
396 aa  216  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24004  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3272  transposase IS4 family protein  67.09 
 
 
390 aa  214  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2904  transposase  67.09 
 
 
389 aa  213  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4421  putative IS4 family transposase  65.24 
 
 
427 aa  207  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0265932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2739  transposase  63.03 
 
 
462 aa  204  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515856  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2877  transposase  63.03 
 
 
462 aa  204  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156235  normal  0.359702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4606  transposase  63.03 
 
 
462 aa  204  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7107  transposase  63.03 
 
 
462 aa  204  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3530  transposase  63.35 
 
 
399 aa  200  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.407698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2600  transposase  63.35 
 
 
399 aa  200  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0535521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1650  transposase IS4 family protein  60.98 
 
 
432 aa  193  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156297  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6714  transposase  60 
 
 
225 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4487  transposase IS4 family protein  53.99 
 
 
403 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  51.2 
 
 
402 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  52.17 
 
 
416 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  52.17 
 
 
416 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  52.17 
 
 
416 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  52.17 
 
 
416 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  52.17 
 
 
416 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  53.69 
 
 
417 aa  154  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  52.08 
 
 
401 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3015  transposase  61.02 
 
 
317 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837317  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3143  transposase IS4 family protein  45.68 
 
 
418 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4639  transposase IS4 family protein  45.68 
 
 
394 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2296  transposase  41.67 
 
 
396 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00584103  normal  0.663647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2511  transposase  41.67 
 
 
396 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160995  normal  0.39101 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  36.42 
 
 
431 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  38.12 
 
 
443 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  38.12 
 
 
445 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  38.12 
 
 
443 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  38.12 
 
 
453 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  38.12 
 
 
453 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  38.12 
 
 
453 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  38.12 
 
 
453 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  35.1 
 
 
430 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0887  transposase  34.32 
 
 
428 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1584  transposase  34.32 
 
 
428 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1668  transposase  34.32 
 
 
428 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000920779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2785  transposase  34.32 
 
 
428 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.948606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3628  transposase  34.32 
 
 
428 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4146  transposase  34.32 
 
 
428 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0165  putative transposase  35.44 
 
 
458 aa  95.5  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172825  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0541  putative transposase  35.44 
 
 
451 aa  95.5  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.305799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0594  putative transposase  35.44 
 
 
451 aa  95.5  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1744  putative transposase  35.44 
 
 
451 aa  95.5  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865016  normal  0.814696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  36.77 
 
 
453 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00295  isrso17-transposase protein  35.76 
 
 
319 aa  93.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00607053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  36.77 
 
 
453 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  34.84 
 
 
463 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3616  transposase  33.96 
 
 
467 aa  92.8  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04166  ISXo8 transposase  50 
 
 
460 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  50 
 
 
460 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4740  putative transposase  34.81 
 
 
358 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  50 
 
 
460 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  34.52 
 
 
460 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  50 
 
 
460 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
439 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
747 aa  87.8  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01070  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
287 aa  87.8  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0916111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01499  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
313 aa  88.2  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.709991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02022  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
327 aa  88.2  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06248  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
287 aa  87.8  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0177744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
747 aa  87.8  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04690  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
550 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05782  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
467 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3929  putative transposase  34.64 
 
 
444 aa  87.8  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
501 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03415  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
403 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
469 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04033  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05750  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.019264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04444  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
293 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01108  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
269 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
467 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06262  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
269 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
382 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03193  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
412 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03542  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
473 aa  87.8  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973721  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04708  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04740  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
460 aa  87.8  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05635  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
405 aa  87.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
467 aa  87.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05780  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
462 aa  87.8  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02784  ISXo8 transposase  47.62 
 
 
313 aa  87.8  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  48.81 
 
 
473 aa  87.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>