25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1056 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1056  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  268  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  97.39 
 
 		 397 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7529  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 457 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.17 
 
 		 418 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4150  hypothetical protein  39.06 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 277 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 431 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0517  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 503 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  41.27 
 
 		 526 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 124 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1676  gp68  34.67 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610076  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4832  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.74 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  46.3 
 
 		 281 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  35.19 
 
 		 399 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  28.97 
 
 		 141 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>