More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0837 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  95.93 
 
 		 470 aa  899    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 		 467 aa  934    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  70.02 
 
 		 463 aa  618  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  63.87 
 
 		 467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  64.38 
 
 		 467 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  62.1 
 
 		 468 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  61.19 
 
 		 495 aa  547  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  61.72 
 
 		 470 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  61.91 
 
 		 481 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  61.19 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  61.72 
 
 		 470 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  61.72 
 
 		 470 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  61.51 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.45 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.23 
 
 		 467 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  64.36 
 
 		 467 aa  528  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  60 
 
 		 493 aa  530  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  60.98 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  60.83 
 
 		 463 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  59.83 
 
 		 479 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  60.79 
 
 		 460 aa  519  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  60.3 
 
 		 460 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  61.67 
 
 		 483 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  62.72 
 
 		 463 aa  514  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  60.79 
 
 		 491 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  60 
 
 		 465 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  56.09 
 
 		 491 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  58.76 
 
 		 495 aa  467  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  56.51 
 
 		 471 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  58.82 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  55.25 
 
 		 471 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  55.25 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  54.18 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  56.22 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  53.39 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  55.84 
 
 		 478 aa  435  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.02 
 
 		 458 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.12 
 
 		 468 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 		 465 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.85 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.39 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.6 
 
 		 474 aa  226  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.12 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.63 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.89 
 
 		 465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 		 459 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.98 
 
 		 480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.21 
 
 		 470 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 		 459 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 		 459 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.33 
 
 		 480 aa  219  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.41 
 
 		 466 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.48 
 
 		 469 aa  216  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.6 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.93 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.22 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.37 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.11 
 
 		 470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 		 459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.98 
 
 		 466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.98 
 
 		 466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 		 462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.22 
 
 		 562 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.68 
 
 		 467 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.39 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.2 
 
 		 465 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 		 463 aa  210  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.93 
 
 		 459 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.53 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.45 
 
 		 471 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 		 467 aa  209  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 		 459 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.9 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.85 
 
 		 491 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 		 460 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 		 469 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.41 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.66 
 
 		 459 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.7 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.7 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.94 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.7 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.7 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.57 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.7 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.7 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.79 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.02 
 
 		 492 aa  207  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.49 
 
 		 470 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.32 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.49 
 
 		 470 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.31 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.56 
 
 		 479 aa  206  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.49 
 
 		 470 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.69 
 
 		 478 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.54 
 
 		 585 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 		 468 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>