82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0209 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
303 aa  590  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  71.05 
 
 
305 aa  359  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  65.87 
 
 
301 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  53.97 
 
 
300 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  54.42 
 
 
305 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  53.18 
 
 
299 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  55.78 
 
 
301 aa  242  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  44.66 
 
 
293 aa  188  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  45.45 
 
 
294 aa  185  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  41.92 
 
 
287 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  39.85 
 
 
300 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  41.7 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  41.18 
 
 
315 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  40.15 
 
 
299 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  36.23 
 
 
293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  34.72 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  39.41 
 
 
305 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  41 
 
 
474 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  33.33 
 
 
292 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  39.11 
 
 
303 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  33.33 
 
 
292 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  38.27 
 
 
310 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  34.34 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  32.96 
 
 
292 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 
291 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  33.09 
 
 
292 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  36.94 
 
 
296 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 
329 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  33.71 
 
 
292 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  36.8 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  35.77 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  37.5 
 
 
534 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  35.99 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  38.49 
 
 
323 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  33.58 
 
 
299 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 
303 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  37.83 
 
 
299 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  36.33 
 
 
293 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  36.86 
 
 
339 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  36.64 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  35.04 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  38.89 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  32.96 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  60 
 
 
838 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  26.19 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  25.85 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  31.87 
 
 
213 aa  63.9  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.91 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1266  aminoglycoside phophotransferase  24.68 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1537  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.79 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2829  aminoglycoside phosphotransferase  30.04 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.077246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1301  aminoglycoside phosphotransferase  23.63 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1468  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.42 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1397  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.42 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1264  aminoglycoside phophotransferase  22.42 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.332261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1292  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.42 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1496  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.84 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1431  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.4 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  30.99 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  39.13 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  28.21 
 
 
271 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  22.12 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2790  aminoglycoside phosphotransferase  23.41 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2472  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0185974  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3913  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.42 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  30.25 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  24.47 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  28.9 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2024  hypothetical protein  47.92 
 
 
333 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.010627  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  30.88 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2181  aminoglycoside phosphotransferase  23.83 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2343  aminoglycoside phosphotransferase  28.27 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.421232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  30.19 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2805  aminoglycoside phosphotransferase  34.09 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.34105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27590  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.85 
 
 
505 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  27.32 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  34.19 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0130  aminoglycoside phosphotransferase  37.33 
 
 
314 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.670297  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1259  homoserine kinase  39.39 
 
 
321 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4256  aminoglycoside phosphotransferase  47.46 
 
 
273 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>