58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4220 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
315 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  55.85 
 
 
303 aa  329  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  55.67 
 
 
339 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  51.02 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  50.17 
 
 
474 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  47.74 
 
 
293 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  48.32 
 
 
299 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  51.39 
 
 
299 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  47.14 
 
 
310 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  49.83 
 
 
305 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  47.24 
 
 
300 aa  255  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  46.02 
 
 
292 aa  255  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  44.83 
 
 
292 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  47.75 
 
 
302 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  45.25 
 
 
332 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  43.45 
 
 
292 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  46.15 
 
 
303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  43.45 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  43.45 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  44.14 
 
 
293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  44.64 
 
 
292 aa  242  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  45.42 
 
 
534 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  45.69 
 
 
291 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  43.77 
 
 
293 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  45.61 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  41.05 
 
 
303 aa  183  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  36.03 
 
 
297 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  40.69 
 
 
287 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  40.08 
 
 
293 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  35.55 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  38.62 
 
 
294 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  38.38 
 
 
300 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  36.03 
 
 
298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  36.16 
 
 
299 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  36.53 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  34.01 
 
 
329 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  41.18 
 
 
303 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  38.29 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  44.61 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  36.46 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  38.75 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  31.27 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  31.73 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  30.57 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  22.43 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  22.43 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  41.03 
 
 
838 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  25.78 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0845  phosphotransferase  52.24 
 
 
74 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.515192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  33.48 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3134  aminoglycoside phosphotransferase family protein  46.34 
 
 
64 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0783  aminoglycoside phosphotransferase  29.72 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.277231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15080  predicted aminoglycoside phosphotransferase  29.74 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.04 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  25.58 
 
 
271 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3085  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  0.971754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  25.11 
 
 
298 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>