50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
315 aa  601  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  32.21 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  33.58 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  31.42 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  34.76 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30.69 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  34.44 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  33.02 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  31.34 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  30.11 
 
 
347 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1786  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 
354 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0286679  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  27.34 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1852  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 
354 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.906902  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1805  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 
354 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1772  aminoglycoside phosphotransferase  26.92 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  29.44 
 
 
450 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  32.93 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1446  macrolide 2-phosphotransferase  28.79 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2979  aminoglycoside phosphotransferase  28.71 
 
 
282 aa  49.3  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0251583  normal  0.510052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  27.78 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0754  aminoglycoside phosphotransferase  22.63 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000796745 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1445  macrolide 2-phosphotransferase  28.03 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1659  putative macrolide 2-phosphotransferase  28.03 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.491646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  29.37 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  29.02 
 
 
300 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
299 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  48.08 
 
 
265 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  29.44 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  32.65 
 
 
301 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  26.48 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  28.51 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3722  putative macrolide 2-phosphotransferase  22.18 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.097524  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2632  aminoglycoside phosphotransferase  27.84 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  34.18 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1473  macrolide 2-phosphotransferase  27.27 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  32.09 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  32.09 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1589  macrolide 2-phosphotransferase  27.27 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.194584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  32.09 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  27.04 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 
267 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  31.46 
 
 
360 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  26.19 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  25.57 
 
 
346 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  27.78 
 
 
297 aa  42.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 
308 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>