52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4063 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
297 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  57.68 
 
 
302 aa  321  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  44.37 
 
 
299 aa  262  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  41.44 
 
 
293 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  36.03 
 
 
315 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  36.82 
 
 
474 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  37.67 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  36 
 
 
302 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  36.9 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 
299 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  37.04 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
310 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  36.05 
 
 
299 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  29.72 
 
 
292 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  32.65 
 
 
299 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  29.66 
 
 
292 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  29.72 
 
 
293 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  28.81 
 
 
292 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 
287 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  31.42 
 
 
291 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  28.47 
 
 
292 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  28.47 
 
 
292 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  30.86 
 
 
534 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  29.67 
 
 
292 aa  135  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  32.76 
 
 
303 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  32.29 
 
 
332 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  32.68 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  35.66 
 
 
324 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  32.76 
 
 
293 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.89 
 
 
329 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
303 aa  89  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  28.95 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  32.71 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  31.29 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  35.09 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  30.9 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  29.84 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  32.01 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  28.79 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  30.07 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  33.86 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  26.35 
 
 
213 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1228  aminoglycoside phosphotransferase  34.08 
 
 
294 aa  48.9  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367094  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  39.44 
 
 
838 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5382  hypothetical protein  31.53 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0231143  normal  0.100402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3085  aminoglycoside phosphotransferase  32 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  0.971754 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  26.04 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.78 
 
 
315 aa  42.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  30.88 
 
 
315 aa  42.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>