78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1996 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
301 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  65.87 
 
 
303 aa  350  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  69.28 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  54.3 
 
 
300 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
299 aa  248  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  56.95 
 
 
305 aa  242  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  53.42 
 
 
301 aa  225  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  43.51 
 
 
294 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  44.32 
 
 
293 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  41.35 
 
 
300 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  40.47 
 
 
287 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 
303 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  44.49 
 
 
298 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  39.78 
 
 
474 aa  152  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  38.29 
 
 
303 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 
291 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  37.32 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  37.96 
 
 
315 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  34.57 
 
 
293 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  33.96 
 
 
293 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  37.97 
 
 
299 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  33.7 
 
 
292 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  32.95 
 
 
292 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  32.95 
 
 
292 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  32.95 
 
 
292 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  33.21 
 
 
292 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  33.46 
 
 
292 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.82 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  39.27 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  34.96 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  34.6 
 
 
534 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  34.71 
 
 
332 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  34.96 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  37.88 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  39.21 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  34.57 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
324 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  32.35 
 
 
302 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  32.71 
 
 
297 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  31.88 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  26.28 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  57.14 
 
 
838 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.22 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  28.1 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  38.69 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  23.26 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  26.06 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.65 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  22.55 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2829  aminoglycoside phosphotransferase  27.45 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.077246  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  29.63 
 
 
321 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2024  hypothetical protein  43.86 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.010627  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2472  aminoglycoside phosphotransferase  34.23 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0185974  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2900  aminoglycoside phosphotransferase  32.58 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123406  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2755  aminoglycoside phosphotransferase  32.77 
 
 
401 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  30.63 
 
 
267 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1266  aminoglycoside phophotransferase  23.87 
 
 
300 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1496  aminoglycoside phophotransferase family protein  20.59 
 
 
300 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1698  aminoglycoside phosphotransferase  34.4 
 
 
321 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2217  hypothetical protein  26.32 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2805  aminoglycoside phosphotransferase  28.67 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.34105  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  25.96 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2477  aminoglycoside phosphotransferase  30.38 
 
 
426 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000140832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15080  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2345  hypothetical protein  26.32 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0609784  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0783  aminoglycoside phosphotransferase  30.22 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.277231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1431  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.85 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1776  aminoglycoside phosphotransferase  30.67 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1175  aminoglycoside phosphotransferase  30.14 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.179937 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2348  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
419 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1763  aminoglycoside phosphotransferase  32.8 
 
 
321 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0022  aminoglycoside phosphotransferase  24.26 
 
 
320 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124869  normal  0.0787609 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6316  aminoglycoside phosphotransferase  32.8 
 
 
321 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2017  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000163983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1537  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.97 
 
 
300 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>