53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4129 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
339 aa  673    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  57.38 
 
 
303 aa  335  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  55.67 
 
 
315 aa  332  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  51.86 
 
 
474 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  47.02 
 
 
293 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  49.83 
 
 
299 aa  276  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  45.52 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  54.65 
 
 
305 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  45.52 
 
 
292 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  45.17 
 
 
292 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  51.93 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  45.17 
 
 
292 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  45.17 
 
 
292 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  44.79 
 
 
293 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  44.48 
 
 
292 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  48.08 
 
 
302 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  49.83 
 
 
299 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  46.69 
 
 
291 aa  255  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  49.26 
 
 
300 aa  255  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  45.3 
 
 
310 aa  245  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  48.25 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  44.75 
 
 
303 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  46.39 
 
 
534 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  43.6 
 
 
287 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 
293 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  41.58 
 
 
303 aa  199  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 
297 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  43.19 
 
 
324 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  40.98 
 
 
293 aa  162  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  34.56 
 
 
302 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  41.89 
 
 
298 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  37.29 
 
 
294 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.04 
 
 
329 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  30.54 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  38.75 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  36.73 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  36.04 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  39.93 
 
 
301 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  39.33 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  41.82 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  36.43 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  37.11 
 
 
301 aa  106  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  35.64 
 
 
305 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  33.08 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  30.87 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  44.12 
 
 
838 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0845  phosphotransferase  57.14 
 
 
74 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.515192  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.88 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3085  aminoglycoside phosphotransferase  36.47 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  0.971754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2477  aminoglycoside phosphotransferase  32.02 
 
 
426 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000140832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5102  hypothetical protein  44.26 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  43.66 
 
 
270 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  33.91 
 
 
376 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>