43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2507 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  33.89 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  33.89 
 
 
292 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  33.89 
 
 
292 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  33.89 
 
 
292 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  35.5 
 
 
293 aa  104  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  35.5 
 
 
292 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  34.32 
 
 
292 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  32.52 
 
 
293 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  34.1 
 
 
291 aa  91.7  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  32.16 
 
 
534 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  29.9 
 
 
299 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  29.68 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  32.21 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 
305 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  44.32 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  30.57 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  27.37 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  32.69 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  31.21 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  42.68 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  31.87 
 
 
303 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 
339 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 
298 aa  62  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  37.86 
 
 
299 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  28.72 
 
 
299 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  32.71 
 
 
303 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  26.35 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  43.18 
 
 
305 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 
305 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  33.78 
 
 
294 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  26.06 
 
 
301 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  25.75 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  26.35 
 
 
297 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  28.42 
 
 
323 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
293 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 
324 aa  49.3  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  38.64 
 
 
299 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  31.43 
 
 
299 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  30.84 
 
 
474 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.73 
 
 
329 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  37.74 
 
 
838 aa  41.6  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>