57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2351 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
332 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  53.04 
 
 
299 aa  299  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  46.77 
 
 
293 aa  298  6e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  50.16 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  46.01 
 
 
292 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  44.76 
 
 
292 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  44.73 
 
 
293 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  48.42 
 
 
302 aa  279  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
300 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  43.81 
 
 
292 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  43.81 
 
 
292 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  43.81 
 
 
292 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  46.18 
 
 
291 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  44.09 
 
 
292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  44.48 
 
 
310 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  45.25 
 
 
315 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  45.37 
 
 
534 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  46.32 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  42.41 
 
 
303 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  43.55 
 
 
339 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  42.32 
 
 
299 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 
299 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  36.39 
 
 
474 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.97 
 
 
303 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  37.74 
 
 
293 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  37.01 
 
 
287 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  36.04 
 
 
293 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  31.06 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  30.79 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
324 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  36.11 
 
 
298 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  34.59 
 
 
300 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  36.18 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  33.78 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.07 
 
 
329 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  34.71 
 
 
301 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  33.66 
 
 
323 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  37.15 
 
 
301 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  34.02 
 
 
305 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  30.18 
 
 
296 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  25.94 
 
 
299 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  29.45 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  44.55 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  27.37 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0845  phosphotransferase  62.5 
 
 
74 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.515192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  44.07 
 
 
838 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  25.43 
 
 
298 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  22.59 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  22.26 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  41.46 
 
 
270 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  26.74 
 
 
293 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2217  hypothetical protein  23.02 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3134  aminoglycoside phosphotransferase family protein  36.07 
 
 
64 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2345  hypothetical protein  23.02 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0609784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3132  aminoglycoside phosphotransferase family protein  43.75 
 
 
50 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3107  hypothetical protein  23.02 
 
 
310 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  hitchhiker  0.000000000942789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>