73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1967 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 299 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  57.54 
 
 		 293 aa  356  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  60.88 
 
 		 300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  60.07 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  58.08 
 
 		 302 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  52.4 
 
 		 292 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  52.23 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  51.37 
 
 		 292 aa  321  7e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  51.03 
 
 		 292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  51.37 
 
 		 292 aa  319  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  51.37 
 
 		 292 aa  319  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  54.7 
 
 		 310 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  51.2 
 
 		 292 aa  315  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  53.04 
 
 		 332 aa  311  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  51.74 
 
 		 291 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  52.35 
 
 		 534 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  50.68 
 
 		 315 aa  278  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 303 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  49.67 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  48.08 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  49.83 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  43.25 
 
 		 474 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  41.81 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  41.54 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  42.75 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  37.74 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  36.05 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  40.96 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  39.53 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  33.22 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  41.04 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  34.27 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  32.88 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  27.7 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  37.74 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  37.69 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  36.24 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  40.67 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  29.9 
 
 		 213 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0845  phosphotransferase  70.31 
 
 		 74 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.515192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  28.37 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  43.75 
 
 		 838 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1496  aminoglycoside phophotransferase family protein  26.67 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1537  aminoglycoside phophotransferase family protein  26.19 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1266  aminoglycoside phophotransferase  26.42 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1102  aminoglycoside phosphotransferase  23.7 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1301  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1468  aminoglycoside phophotransferase family protein  27.01 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1292  aminoglycoside phophotransferase family protein  27.01 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1264  aminoglycoside phophotransferase  27.01 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.332261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1397  aminoglycoside phophotransferase family protein  27.01 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3913  aminoglycoside phophotransferase family protein  27.57 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  30.09 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3134  aminoglycoside phosphotransferase family protein  39.34 
 
 		 64 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  22.27 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  22.33 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  22.69 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3132  aminoglycoside phosphotransferase family protein  40 
 
 		 50 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2761  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2806  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0356715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3085  aminoglycoside phosphotransferase  41.18 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  0.971754 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1585  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.616804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22410  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.08 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0662626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2477  aminoglycoside phosphotransferase  30.96 
 
 		 426 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000140832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2755  aminoglycoside phosphotransferase  29.44 
 
 		 401 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133804  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0783  aminoglycoside phosphotransferase  45.76 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.277231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  25.62 
 
 		 343 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>