52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0159 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  100 
 
 		 271 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1717  aminoglycoside phosphotransferase  39.62 
 
 		 267 aa  161  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0195  aminoglycoside phosphotransferase  35.06 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000752934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3721  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  35.06 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0966  aminoglycoside phosphotransferase  36.43 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.238435  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2951  aminoglycoside phosphotransferase  34.35 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863477  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2197  aminoglycoside phosphotransferase  33.6 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0392528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10670  aminoglycoside 3'-phosphotransferase type IIB  32.96 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2693  aminoglycoside phosphotransferase  34.09 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.876153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0973  aminoglycoside 3-phosphotransferase type IIB  33.86 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2256  aminoglycoside phosphotransferase  33.58 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1320  aminoglycoside phosphotransferase  34.66 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3368  aminoglycoside phosphotransferase  29.57 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5038  Kanamycin kinase  28.74 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0328553 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0010  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  29.96 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.590749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1799  aminoglycoside phosphotransferase  29.75 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4099  3''-kinase  33.2 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0369  aminoglycoside phosphotransferase  26.12 
 
 		 258 aa  95.9  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000170406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6179  aminoglycoside phosphotransferase  29.66 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0454  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  30.14 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1184  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.775153  normal  0.354741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1990  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2292  aminoglycoside phosphotransferase  28.24 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168028  normal  0.166014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6646  3''-kinase  31.56 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3941  3''-kinase  31.56 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  hitchhiker  0.00925302 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0004  streptomycin resistance protein, StrA  29.92 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0128  aminoglycoside resistance protein A  29.92 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0046  streptomycin resistance protein StrA  29.92 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2669  aminoglycoside phosphotransferase  29.92 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0328052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1570  aminoglycoside resistance protein A  29.62 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0085  aminoglycoside resistance protein A  29.92 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13851  phosphotransferase  29.34 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.612969 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1458  aminoglycoside phosphotransferase  29.06 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.158557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3531  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1464  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3224  aminoglycoside phosphotransferase  29.38 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  hitchhiker  0.00000286784 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  31.51 
 
 		 534 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1330  aminoglycoside phosphotransferase  25.86 
 
 		 226 aa  52.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  27.82 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 		 303 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  35.59 
 
 		 474 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0156  hypothetical protein  24.79 
 
 		 556 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  27.37 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  29.87 
 
 		 443 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  29.7 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  26.7 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  25.58 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  23.94 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  26.04 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  23.57 
 
 		 303 aa  42.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>