49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3224 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3224  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
443 aa  872    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  hitchhiker  0.00000286784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3368  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
268 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0249921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0195  aminoglycoside phosphotransferase  30.16 
 
 
264 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000752934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0966  aminoglycoside phosphotransferase  29.1 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.238435  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3721  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  31.4 
 
 
264 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1717  aminoglycoside phosphotransferase  30.94 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4099  3''-kinase  33.01 
 
 
273 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2197  aminoglycoside phosphotransferase  36.82 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0392528  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1570  aminoglycoside resistance protein A  31.15 
 
 
302 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2669  aminoglycoside phosphotransferase  31.15 
 
 
267 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0328052  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0128  aminoglycoside resistance protein A  31.15 
 
 
267 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0004  streptomycin resistance protein, StrA  31.15 
 
 
267 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0046  streptomycin resistance protein StrA  31.15 
 
 
267 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0085  aminoglycoside resistance protein A  31.15 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2292  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168028  normal  0.166014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3941  3''-kinase  31.46 
 
 
273 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  hitchhiker  0.00925302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1990  aminoglycoside phosphotransferase  34.1 
 
 
243 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6646  3''-kinase  31.46 
 
 
273 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10670  aminoglycoside 3'-phosphotransferase type IIB  30.48 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2951  aminoglycoside phosphotransferase  30.23 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863477  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0973  aminoglycoside 3-phosphotransferase type IIB  30.26 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1320  aminoglycoside phosphotransferase  29.33 
 
 
266 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  29.38 
 
 
271 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5038  Kanamycin kinase  35.43 
 
 
244 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0328553 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2693  aminoglycoside phosphotransferase  29.04 
 
 
263 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.876153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6179  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 
267 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1184  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 
282 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.775153  normal  0.354741 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  25.36 
 
 
244 aa  53.9  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0369  aminoglycoside phosphotransferase  23.9 
 
 
258 aa  53.5  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000170406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0454  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  33.8 
 
 
270 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3531  aminoglycoside phosphotransferase  30.5 
 
 
300 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  30.39 
 
 
368 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1799  aminoglycoside phosphotransferase  35.32 
 
 
256 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  29.9 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  29.9 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13851  phosphotransferase  34.52 
 
 
251 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.612969 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  29.9 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  29.9 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  29.9 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  29.41 
 
 
368 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2256  aminoglycoside phosphotransferase  31.55 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  24.48 
 
 
354 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 
355 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  23.01 
 
 
337 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  26.47 
 
 
343 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  27.72 
 
 
343 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  26.23 
 
 
353 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  27.17 
 
 
353 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0010  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  24.29 
 
 
264 aa  43.1  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.590749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>