38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2256 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2256  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2951  aminoglycoside phosphotransferase  42 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863477  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1717  aminoglycoside phosphotransferase  42.8 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0966  aminoglycoside phosphotransferase  41.64 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.238435  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1320  aminoglycoside phosphotransferase  48.57 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0973  aminoglycoside 3-phosphotransferase type IIB  42.4 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10670  aminoglycoside 3'-phosphotransferase type IIB  42.02 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3721  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  40.8 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0195  aminoglycoside phosphotransferase  40.4 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000752934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2693  aminoglycoside phosphotransferase  42 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.876153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0369  aminoglycoside phosphotransferase  33.72 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000170406  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  33.58 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2197  aminoglycoside phosphotransferase  36.54 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0392528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5038  Kanamycin kinase  39.45 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0328553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3368  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1990  aminoglycoside phosphotransferase  42.57 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4099  3''-kinase  35.46 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0010  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  32.22 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.590749  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1458  aminoglycoside phosphotransferase  31.31 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.158557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6646  3''-kinase  34.38 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3941  3''-kinase  34.38 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  hitchhiker  0.00925302 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0004  streptomycin resistance protein, StrA  31.5 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0046  streptomycin resistance protein StrA  31.5 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2669  aminoglycoside phosphotransferase  31.5 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0328052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0085  aminoglycoside resistance protein A  31.5 
 
 		 329 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1570  aminoglycoside resistance protein A  31.5 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0128  aminoglycoside resistance protein A  31.5 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1799  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3531  aminoglycoside phosphotransferase  36.96 
 
 		 300 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0454  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  33.33 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2292  aminoglycoside phosphotransferase  31.27 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168028  normal  0.166014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13851  phosphotransferase  34.53 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.612969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6179  aminoglycoside phosphotransferase  33.49 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1184  aminoglycoside phosphotransferase  36.19 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.775153  normal  0.354741 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1330  aminoglycoside phosphotransferase  25.46 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1464  aminoglycoside phosphotransferase  31.84 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3224  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 443 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  hitchhiker  0.00000286784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5845  aminoglycoside phosphotransferase  34.69 
 
 		 345 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>