36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2669 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2669  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
267 aa  543  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0328052  normal 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0004  streptomycin resistance protein, StrA  100 
 
 
267 aa  543  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0046  streptomycin resistance protein StrA  100 
 
 
267 aa  543  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1570  aminoglycoside resistance protein A  99.63 
 
 
302 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0128  aminoglycoside resistance protein A  99.63 
 
 
267 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0085  aminoglycoside resistance protein A  99.63 
 
 
329 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2292  aminoglycoside phosphotransferase  56.69 
 
 
273 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168028  normal  0.166014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4099  3''-kinase  49.24 
 
 
273 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3941  3''-kinase  46.95 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  hitchhiker  0.00925302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6646  3''-kinase  46.95 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1990  aminoglycoside phosphotransferase  38.97 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1320  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
266 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2197  aminoglycoside phosphotransferase  33.46 
 
 
264 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0392528  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0195  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 
264 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000752934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3721  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  34.25 
 
 
264 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3368  aminoglycoside phosphotransferase  33.98 
 
 
268 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0249921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2951  aminoglycoside phosphotransferase  34.52 
 
 
265 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863477  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1717  aminoglycoside phosphotransferase  34.44 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0966  aminoglycoside phosphotransferase  32.44 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.238435  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0454  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  34.8 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0369  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000170406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6179  aminoglycoside phosphotransferase  35.06 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2693  aminoglycoside phosphotransferase  31.43 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.876153  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10670  aminoglycoside 3'-phosphotransferase type IIB  31.3 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0973  aminoglycoside 3-phosphotransferase type IIB  30.87 
 
 
268 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  29.92 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2256  aminoglycoside phosphotransferase  30.71 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1799  aminoglycoside phosphotransferase  32.37 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1464  aminoglycoside phosphotransferase  33.06 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13851  phosphotransferase  32.42 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.612969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1184  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.775153  normal  0.354741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5038  Kanamycin kinase  32.75 
 
 
244 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0328553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3224  aminoglycoside phosphotransferase  31.15 
 
 
443 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  hitchhiker  0.00000286784 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0010  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  25.21 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.590749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3531  aminoglycoside phosphotransferase  25.49 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1458  aminoglycoside phosphotransferase  23.16 
 
 
261 aa  45.8  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.158557  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>