36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2292 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2292  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
273 aa  554  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168028  normal  0.166014 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0085  aminoglycoside resistance protein A  54.38 
 
 
329 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1570  aminoglycoside resistance protein A  54.38 
 
 
302 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2669  aminoglycoside phosphotransferase  56.69 
 
 
267 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0328052  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0046  streptomycin resistance protein StrA  56.69 
 
 
267 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0128  aminoglycoside resistance protein A  56.69 
 
 
267 aa  299  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0004  streptomycin resistance protein, StrA  56.69 
 
 
267 aa  299  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4099  3''-kinase  49.01 
 
 
273 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6646  3''-kinase  47.66 
 
 
273 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3941  3''-kinase  47.66 
 
 
273 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  hitchhiker  0.00925302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1990  aminoglycoside phosphotransferase  38.74 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0195  aminoglycoside phosphotransferase  33.59 
 
 
264 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000752934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3721  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  33.88 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2197  aminoglycoside phosphotransferase  34.36 
 
 
264 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0392528  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3368  aminoglycoside phosphotransferase  34.87 
 
 
268 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0249921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1717  aminoglycoside phosphotransferase  34.64 
 
 
267 aa  99  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2256  aminoglycoside phosphotransferase  31.64 
 
 
259 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0966  aminoglycoside phosphotransferase  30.52 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.238435  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1320  aminoglycoside phosphotransferase  32.91 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  28.24 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10670  aminoglycoside 3'-phosphotransferase type IIB  30.77 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0973  aminoglycoside 3-phosphotransferase type IIB  33.05 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0454  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  32.61 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2951  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863477  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6179  aminoglycoside phosphotransferase  31.09 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13851  phosphotransferase  32.05 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.612969 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0369  aminoglycoside phosphotransferase  25.4 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000170406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3224  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  hitchhiker  0.00000286784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1464  aminoglycoside phosphotransferase  46.43 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2693  aminoglycoside phosphotransferase  32.97 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.876153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5038  Kanamycin kinase  28.65 
 
 
244 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0328553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1184  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.775153  normal  0.354741 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1458  aminoglycoside phosphotransferase  24.51 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.158557  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0010  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  25.89 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.590749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1799  aminoglycoside phosphotransferase  26.59 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1330  aminoglycoside phosphotransferase  23.71 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>