40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2197 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2197  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
264 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0392528  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0195  aminoglycoside phosphotransferase  63.26 
 
 
264 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000752934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3721  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  63.26 
 
 
264 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0973  aminoglycoside 3-phosphotransferase type IIB  50.97 
 
 
268 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1717  aminoglycoside phosphotransferase  51.16 
 
 
267 aa  234  8e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10670  aminoglycoside 3'-phosphotransferase type IIB  50.19 
 
 
267 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2951  aminoglycoside phosphotransferase  49.4 
 
 
265 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863477  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1320  aminoglycoside phosphotransferase  49.38 
 
 
266 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2693  aminoglycoside phosphotransferase  44.98 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.876153  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0966  aminoglycoside phosphotransferase  40.32 
 
 
270 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.238435  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  33.6 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2256  aminoglycoside phosphotransferase  36.15 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0369  aminoglycoside phosphotransferase  29.96 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000170406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4099  3''-kinase  37.37 
 
 
273 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5038  Kanamycin kinase  35.92 
 
 
244 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0328553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6179  aminoglycoside phosphotransferase  38.89 
 
 
267 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0010  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  32.53 
 
 
264 aa  109  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.590749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2669  aminoglycoside phosphotransferase  33.46 
 
 
267 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0328052  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0046  streptomycin resistance protein StrA  33.46 
 
 
267 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0004  streptomycin resistance protein, StrA  33.46 
 
 
267 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0128  aminoglycoside resistance protein A  33.46 
 
 
267 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1570  aminoglycoside resistance protein A  33.46 
 
 
302 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0085  aminoglycoside resistance protein A  33.46 
 
 
329 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2292  aminoglycoside phosphotransferase  34.36 
 
 
273 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168028  normal  0.166014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6646  3''-kinase  35.94 
 
 
273 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3941  3''-kinase  35.94 
 
 
273 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  hitchhiker  0.00925302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0454  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  37.23 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3368  aminoglycoside phosphotransferase  32.34 
 
 
268 aa  99  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0249921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1799  aminoglycoside phosphotransferase  35.19 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1990  aminoglycoside phosphotransferase  34.4 
 
 
243 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1464  aminoglycoside phosphotransferase  33.77 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13851  phosphotransferase  34.78 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.612969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1184  aminoglycoside phosphotransferase  35.2 
 
 
282 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.775153  normal  0.354741 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1458  aminoglycoside phosphotransferase  28.77 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.158557  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3224  aminoglycoside phosphotransferase  36.82 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  hitchhiker  0.00000286784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3531  aminoglycoside phosphotransferase  28.72 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1330  aminoglycoside phosphotransferase  26.22 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 
443 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  27.04 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0510  aminoglycoside phosphotransferase  24.11 
 
 
322 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>