47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1175 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1175  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
315 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.179937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2900  aminoglycoside phosphotransferase  57.7 
 
 
386 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123406  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0783  aminoglycoside phosphotransferase  53.87 
 
 
306 aa  258  8e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.277231  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2472  aminoglycoside phosphotransferase  54 
 
 
312 aa  241  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0185974  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2477  aminoglycoside phosphotransferase  45.3 
 
 
426 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000140832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2755  aminoglycoside phosphotransferase  44.3 
 
 
401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133804  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27590  predicted aminoglycoside phosphotransferase  51.64 
 
 
505 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0713  aminoglycoside phosphotransferase  45.97 
 
 
455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15080  predicted aminoglycoside phosphotransferase  41.45 
 
 
345 aa  169  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11380  predicted aminoglycoside phosphotransferase  36.3 
 
 
321 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19180  predicted aminoglycoside phosphotransferase  37.27 
 
 
306 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209047  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
298 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0109  putative aminoglycoside phosphotransferase  27.96 
 
 
551 aa  86.7  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3722  putative macrolide 2-phosphotransferase  24.02 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.097524  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2821  aminoglycoside phosphotransferase  32.16 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1589  macrolide 2-phosphotransferase  23.44 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.194584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1473  macrolide 2-phosphotransferase  23.44 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1445  macrolide 2-phosphotransferase  23.69 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1659  putative macrolide 2-phosphotransferase  23.69 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.491646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1658  aminoglycoside phosphotransferase  31.13 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336937  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1446  macrolide 2-phosphotransferase  23.29 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22410  predicted aminoglycoside phosphotransferase  29.11 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0662626  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0444  hypothetical protein  26.21 
 
 
598 aa  68.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1496  aminoglycoside phophotransferase family protein  25 
 
 
300 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1537  aminoglycoside phophotransferase family protein  25 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1266  aminoglycoside phophotransferase  25 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1292  aminoglycoside phophotransferase family protein  25 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1397  aminoglycoside phophotransferase family protein  25 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1264  aminoglycoside phophotransferase  25 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.332261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1468  aminoglycoside phophotransferase family protein  25 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1431  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.48 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3913  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.08 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1301  aminoglycoside phosphotransferase  23.64 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2024  hypothetical protein  26 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.010627  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  24.28 
 
 
293 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2829  aminoglycoside phosphotransferase  28.46 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.077246  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  23.31 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  23.87 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2343  aminoglycoside phosphotransferase  37.25 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.421232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  20.75 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1228  aminoglycoside phosphotransferase  32.85 
 
 
294 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367094  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  30.39 
 
 
319 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  31.93 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  31.93 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  30.96 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>