55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2024 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2024  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  694    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.010627  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1431  aminoglycoside phophotransferase family protein  25.3 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3913  aminoglycoside phophotransferase family protein  25.3 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1496  aminoglycoside phophotransferase family protein  25.37 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1301  aminoglycoside phosphotransferase  25.94 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1468  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.9 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1292  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.9 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1264  aminoglycoside phophotransferase  23.9 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.332261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1397  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.9 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1537  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.9 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1266  aminoglycoside phophotransferase  23.84 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  25.76 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2829  aminoglycoside phosphotransferase  24.29 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.077246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  24.91 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  24.91 
 
 
293 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1102  aminoglycoside phosphotransferase  23.65 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  28.09 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1585  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase  21.37 
 
 
479 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.616804  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2761  aminoglycoside phosphotransferase  21.37 
 
 
479 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2806  aminoglycoside phosphotransferase  21.37 
 
 
479 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0356715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  40.28 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2900  aminoglycoside phosphotransferase  29.51 
 
 
386 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123406  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  33.96 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  24.78 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  33.07 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1175  aminoglycoside phosphotransferase  27.62 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.179937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  43.86 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  52.17 
 
 
298 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  26.64 
 
 
270 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  29.56 
 
 
300 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1658  aminoglycoside phosphotransferase  22.69 
 
 
299 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336937  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2821  aminoglycoside phosphotransferase  25.1 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  25.39 
 
 
339 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  47.92 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.37 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4606  Viomycin kinase  23.44 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0226508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.37 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2608  aminoglycoside phosphotransferase  28.89 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.37 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  33.78 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1446  macrolide 2-phosphotransferase  22.41 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  35.11 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1659  putative macrolide 2-phosphotransferase  22.41 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.491646 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3722  putative macrolide 2-phosphotransferase  23.24 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.097524  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1445  macrolide 2-phosphotransferase  22.41 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1473  macrolide 2-phosphotransferase  21.43 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1589  macrolide 2-phosphotransferase  21.43 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.194584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  25.67 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.17 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  50.88 
 
 
305 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22410  predicted aminoglycoside phosphotransferase  24.9 
 
 
298 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0662626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1801  hypothetical protein  33.7 
 
 
220 aa  43.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00869097 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.17 
 
 
292 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  24.63 
 
 
292 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>