More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3643 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0333  arginyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 572 aa  656    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3643  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 571 aa  1155    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2169  arginyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 577 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1756  arginyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 577 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01847  arginyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1764  arginyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2442  arginyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01836  hypothetical protein  41.1 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2613  arginyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1310  arginyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 577 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1971  arginyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 577 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2108  arginyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2379  arginyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 579 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222047  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2124  arginyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 577 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  hitchhiker  0.0000003636 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2064  arginyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.10003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2069  arginyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 577 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1213  arginyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1337  arginyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 577 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3779  arginyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 581 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2043  arginyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 576 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2169  arginyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 585 aa  425  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2434  arginyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 576 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.035286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2155  arginyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 576 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0808745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2791  arginyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 576 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01368  arginyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 577 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004100  arginyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000862961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4123  arginyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3357  arginyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0378  arginyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3845  arginyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0550  arginyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 581 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0498  arginyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 581 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0495  arginyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 581 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0955  arginyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 577 aa  415  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3496  arginyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 581 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0456  arginyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 581 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1807  arginyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 576 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.426497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3673  arginyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 581 aa  415  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4427  arginyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 581 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0474  arginyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 581 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2110  arginyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 577 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.102153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0533  arginyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 581 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.142076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2084  arginyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 576 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3762  arginyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0761225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0443  arginyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1661  arginyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 599 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2270  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 576 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2173  arginyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5089  arginyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 578 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5138  arginyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 578 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4962  arginyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 578 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0276  arginyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 578 aa  401  9.999999999999999e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1633  arginyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 565 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00726529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0397  arginyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 579 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1915  arginyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00499149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0399  arginyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 578 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0376  arginyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 578 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5139  arginyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 578 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4134  arginyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 577 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440291  hitchhiker  0.000000042149 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1577  arginyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 590 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1359  arginyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 578 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1110  arginyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 582 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0535  arginyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 579 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1251  arginyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 566 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0998852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3671  arginyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 585 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2566  arginyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 590 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02786  arginyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 576 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0525  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 585 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0542  arginyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 585 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5788  arginyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 587 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3561  arginyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 588 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1335  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66750  arginyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45360  arginyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621239  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0269  arginyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 576 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08210  arginyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 566 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2606  arginyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 574 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0006  arginyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 582 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02161  arginyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 602 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3238  arginyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0065  arginyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 563 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.079588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2103  arginyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 563 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00628973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1535  arginyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 624 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36013  predicted protein  35.71 
 
 		 573 aa  361  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0413  arginyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 565 aa  360  5e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2318  arginyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 562 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273467  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2060  arginyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 585 aa  357  3.9999999999999996e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571937  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0189  arginyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 604 aa  357  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.177771  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02051  arginyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 604 aa  357  5e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2198  arginyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 562 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02621  arginyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 607 aa  357  5e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0249545  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1974  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 562 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1644  arginyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 640 aa  356  6.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.705073  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02071  arginyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 604 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1992  arginyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 562 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0418452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2010  arginyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 562 aa  355  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2323  arginyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 564 aa  354  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2021  arginyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 562 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000995488  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1554  arginyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 607 aa  354  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2175  arginyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 562 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000337819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>