213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0355 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0355  Phosphopentomutase  100 
 
 
402 aa  822    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03232  predicted mutase  54.64 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3757  putative mutase  54.64 
 
 
408 aa  467  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03184  hypothetical protein  54.64 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0333  putative mutase  54.64 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3575  putative mutase  54.64 
 
 
408 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3849  putative mutase  54.64 
 
 
408 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0333  Phosphopentomutase  54.39 
 
 
408 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3656  putative mutase  54.39 
 
 
408 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4006  putative mutase  54.3 
 
 
411 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0181  putative mutase  50.37 
 
 
400 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  29.89 
 
 
394 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  28.7 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  29.28 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  29.88 
 
 
390 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  29.16 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  28.95 
 
 
389 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  27.1 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  29.66 
 
 
394 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  29.66 
 
 
394 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  29.02 
 
 
406 aa  139  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  29.66 
 
 
394 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  29.1 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  29.1 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  29.43 
 
 
394 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  29.43 
 
 
394 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  29.43 
 
 
394 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  29.43 
 
 
394 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  29.58 
 
 
388 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  27.55 
 
 
397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  28.54 
 
 
406 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  30.27 
 
 
392 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  27.52 
 
 
406 aa  132  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  28.94 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  29.3 
 
 
407 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  28.71 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  27.78 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  28.85 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  29.17 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  29.17 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  28.44 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  28.05 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  28.77 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  28.06 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  29.41 
 
 
407 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  29.41 
 
 
407 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  28.97 
 
 
396 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  29.41 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  29.41 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  29.41 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  29.41 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  28.74 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  29.41 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  29.41 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  29.41 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  28.05 
 
 
407 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  28.74 
 
 
393 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  28.6 
 
 
407 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  28.6 
 
 
407 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  28.6 
 
 
407 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  28.6 
 
 
407 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  29.55 
 
 
392 aa  125  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  29.31 
 
 
388 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  29.69 
 
 
397 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  29.15 
 
 
391 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  28.14 
 
 
407 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  28.06 
 
 
409 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  27.8 
 
 
407 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  25.35 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  26.35 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  26.08 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  27.23 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  28.31 
 
 
392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  28.31 
 
 
392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  27.14 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  26.74 
 
 
397 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  28.85 
 
 
420 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  29.95 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  27.53 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  28.7 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  26.08 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  26.08 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  26.08 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  26.08 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  26.15 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  26.82 
 
 
407 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  26.86 
 
 
406 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  25.7 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  25.68 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  27.4 
 
 
390 aa  117  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  26.07 
 
 
407 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  28.71 
 
 
385 aa  116  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  27.55 
 
 
349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  25.9 
 
 
404 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  25.45 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  24.26 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  25.43 
 
 
388 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  24.94 
 
 
389 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  27.17 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  26.13 
 
 
406 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>