More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1301 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1301  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  100 
 
 		 352 aa  683    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1898  NADH dehydrogenase subunit H  66.19 
 
 		 352 aa  490  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180885  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1082  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.3 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.524281  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2048  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.3 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110372 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0328  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.21 
 
 		 320 aa  202  8e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2275  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.35 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0754968  normal  0.291328 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0303  NADH dehydrogenase subunit H  37.84 
 
 		 361 aa  196  7e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.594505 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1793  NADH dehydrogenase (quinone)  38.92 
 
 		 320 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.096157  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0658  NADH dehydrogenase subunit H  36.84 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0515  NADH dehydrogenase subunit H  37.61 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1633  NADH dehydrogenase subunit H  37.34 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0646  NADH dehydrogenase subunit H  37.79 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.411826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  34.01 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  33.82 
 
 		 384 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  33.62 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  32.56 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  32.66 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  33.73 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  31.32 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  33.73 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  33.73 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  31.79 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  31.12 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  31.95 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  31.78 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  32.07 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.92 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  33.64 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1998  NADH dehydrogenase subunit H  34.02 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  31.65 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  32.28 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  32.83 
 
 		 341 aa  143  6e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  32.28 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.02 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  31.04 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  30.79 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  30.12 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  32.81 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  32.66 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  33.44 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.48 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  33.54 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.09 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  30.75 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.13 
 
 		 348 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  32.91 
 
 		 341 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0785  NADH dehydrogenase subunit H  32.61 
 
 		 348 aa  139  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.181346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  33.03 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  34.92 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.22 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  31.73 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  33.03 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2416  NADH dehydrogenase subunit H  33.75 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792289  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  31.97 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  32.34 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  31.12 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2411  NADH dehydrogenase subunit H  33.65 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  31.49 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3291  NADH dehydrogenase subunit H  33.23 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347185  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  32.69 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1184  NADH dehydrogenase subunit H  32.84 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503975  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  28.69 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  31.15 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  31.66 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2522  NADH dehydrogenase subunit H  32.84 
 
 		 345 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.79 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.87 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0804  NADH dehydrogenase subunit H  33.44 
 
 		 347 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0809  NADH dehydrogenase subunit H  33.44 
 
 		 347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519776  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  32.91 
 
 		 369 aa  135  7.000000000000001e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  30.45 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  31.07 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  32.29 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.14 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1321  NADH dehydrogenase subunit H  32.2 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967577  normal  0.0180993 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  32.38 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2925  NADH dehydrogenase subunit H  31.56 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.45 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.74 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  31.99 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  30.34 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  28.36 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  32.08 
 
 		 367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.65 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.06 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0753  NADH dehydrogenase subunit H  31.87 
 
 		 345 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1029  NADH dehydrogenase subunit H  32.77 
 
 		 347 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182867  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  30.34 
 
 		 341 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  30.62 
 
 		 347 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>