23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9361 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  724    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  50.92 
 
 		 399 aa  258  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  45 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  41.6 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  39.3 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  39.76 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  34.93 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  29.43 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  28.8 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  29.18 
 
 		 520 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  32.55 
 
 		 407 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  29.83 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  28.94 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  29.63 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  29.63 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  25.16 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  27.3 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  29.44 
 
 		 634 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  29.82 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  36.84 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  24.06 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  34.62 
 
 		 714 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  34.64 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>