201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3263 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  764    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  66.22 
 
 
373 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2127  putative transposase  74.23 
 
 
224 aa  288  9e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1237  putative transposase  68.67 
 
 
172 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  33.53 
 
 
341 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2891  hypothetical protein  39.75 
 
 
197 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.20151  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5771  hypothetical protein  33.62 
 
 
250 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  27.74 
 
 
357 aa  96.3  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  27.74 
 
 
357 aa  96.3  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  27.74 
 
 
357 aa  96.3  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  27.74 
 
 
357 aa  96.3  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  27.74 
 
 
357 aa  96.3  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  29.6 
 
 
370 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4365  hypothetical protein  43.09 
 
 
176 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  28.66 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  24.34 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  23.69 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  23.69 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  23.69 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  23.69 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  23.69 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  23.69 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  28.94 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  23.69 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  23.69 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  27.71 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  27.27 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  25.71 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  23.69 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  24.78 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  23.69 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  24.78 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  24.78 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  24.78 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  26.99 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  25.68 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  24.09 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  25 
 
 
363 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  26.99 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  28.44 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  28.44 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  26.59 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  26.84 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  27.07 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  27.93 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  27.07 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  27.07 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  27.07 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  27.07 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  26.84 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  26.84 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  26.84 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  26.84 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  27.07 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  26.69 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  28.09 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  29.01 
 
 
285 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  25.96 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  25.96 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  25.96 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  24.7 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  29.17 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  25.8 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  26.21 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  27.07 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  27.07 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  27.07 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  24.03 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  26.49 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  26.49 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  25.16 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  26.2 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  26.2 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  25.83 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  26.37 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  26.37 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  25.83 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  25.83 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  25.89 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  25.89 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  25.89 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  25.89 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  25.89 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  25.89 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  24.2 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  24.2 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  24.2 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  24.87 
 
 
361 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  24.87 
 
 
361 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  24.87 
 
 
361 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  26.79 
 
 
362 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  26.39 
 
 
353 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  26.39 
 
 
353 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  26.79 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  26.79 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  26.54 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  23.51 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  29.41 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  23.51 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  27 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>