215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2777 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2777  Glycerate kinase  100 
 
 		 421 aa  803    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  57.25 
 
 		 377 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  56.9 
 
 		 375 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  49.76 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  47.93 
 
 		 397 aa  285  8e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0243  glycerate kinase  51.18 
 
 		 377 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  52.53 
 
 		 385 aa  275  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  49.18 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08140  glycerate kinase  48.48 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1476  glycerate kinase  54.16 
 
 		 377 aa  262  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  46.42 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  43.51 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  46.41 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  42.93 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  45.09 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  44.86 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  43.77 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  45.62 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  43.77 
 
 		 381 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  43.6 
 
 		 381 aa  236  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  42.34 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  44.56 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  44.78 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  41.97 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  43.77 
 
 		 381 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4727  glycerate kinase  51.87 
 
 		 511 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  46.67 
 
 		 388 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  46.67 
 
 		 388 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  46.41 
 
 		 388 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  41.63 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  41.73 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  41.49 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  41.73 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  43.77 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  45.15 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  43.72 
 
 		 380 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  46.55 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0440  Glycerate kinase  40.76 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  40.62 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  38.72 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  42.07 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  43.5 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  42.07 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  42.07 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  42.07 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  42.49 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  41.59 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  41.98 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  41.49 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  41.81 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  41.81 
 
 		 381 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  39.19 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  39.19 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  40.87 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  39.86 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0239  Glycerate kinase  41.19 
 
 		 374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  42.35 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  38.38 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  36.08 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  34.44 
 
 		 380 aa  212  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4821  glycerate kinase  44.13 
 
 		 377 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12960  glycerate kinase  41.25 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  39.52 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  36.78 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  39.86 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  39.13 
 
 		 381 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  37.29 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  39.14 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14280  glycerate kinase  40.71 
 
 		 396 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000570843  normal  0.0813973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  44.15 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  42.67 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  41.4 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  38.87 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  43.38 
 
 		 384 aa  206  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  37.56 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  38.36 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  39.71 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  39.71 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  40.52 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  36.9 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  39.47 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  38.14 
 
 		 381 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  40.05 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  37.97 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  39.29 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0208  glycerate kinase  37.08 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00158746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  44.5 
 
 		 380 aa  202  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  35.31 
 
 		 381 aa  202  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  39.47 
 
 		 380 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  41.49 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  41.49 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  41.25 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  37.44 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  41.49 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0123  glycerate kinase  40.43 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  42.4 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  37.44 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  36.64 
 
 		 378 aa  199  9e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  39.23 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  40.33 
 
 		 379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>