48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3575 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3575    100 
 
 
515 bp  1021    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1538    81.8 
 
 
1007 bp  238  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.987441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1377    83.64 
 
 
1010 bp  226  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3114    85.02 
 
 
298 bp  212  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  80.45 
 
 
991 bp  194  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  81.47 
 
 
978 bp  186  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  85.5 
 
 
951 bp  167  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  85.29 
 
 
978 bp  167  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  81.72 
 
 
597 bp  165  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  81.72 
 
 
597 bp  165  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  81.34 
 
 
978 bp  157  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  81.34 
 
 
978 bp  157  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  83.98 
 
 
978 bp  147  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  88.03 
 
 
978 bp  147  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1889  hypothetical protein  92.93 
 
 
267 bp  141  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  87.77 
 
 
981 bp  141  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  83.33 
 
 
978 bp  139  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  87.32 
 
 
978 bp  139  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  87.68 
 
 
978 bp  139  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  83.41 
 
 
978 bp  137  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  80.32 
 
 
978 bp  127  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  90.91 
 
 
978 bp  125  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    89.36 
 
 
902 bp  107  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  84.51 
 
 
978 bp  107  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    89.36 
 
 
1107 bp  107  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  84.51 
 
 
978 bp  107  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  84.51 
 
 
978 bp  107  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1859    93.15 
 
 
930 bp  105  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434219  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  83.67 
 
 
978 bp  101  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  88.04 
 
 
978 bp  95.6  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  88.04 
 
 
960 bp  95.6  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3809  hypothetical protein  89.29 
 
 
339 bp  95.6  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  88.04 
 
 
978 bp  95.6  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  83.22 
 
 
978 bp  93.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  86.96 
 
 
978 bp  87.7  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1571  hypothetical protein  86.73 
 
 
201 bp  83.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641007  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  88.14 
 
 
624 bp  61.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  88.68 
 
 
243 bp  58  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0945    88.68 
 
 
479 bp  58  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1858    90.91 
 
 
210 bp  56  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681721  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  90.48 
 
 
315 bp  52  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2174  hypothetical protein  82.56 
 
 
231 bp  52  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  90.48 
 
 
882 bp  52  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  94.12 
 
 
978 bp  52  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  94.12 
 
 
978 bp  52  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0134  hypothetical protein  86.79 
 
 
111 bp  50.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  88.64 
 
 
561 bp  48.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  91.43 
 
 
978 bp  46.1  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>