More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1252 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1499  glycogen synthase  68.79 
 
 		 534 aa  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3023  Starch synthase catalytic domain protein  74.62 
 
 		 539 aa  816    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.917039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1361  starch synthase catalytic subunit  74.77 
 
 		 537 aa  812    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1335  starch synthase catalytic domain protein  74.81 
 
 		 539 aa  812    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2754  starch synthase  69.59 
 
 		 529 aa  742    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2832  starch synthase  69.96 
 
 		 529 aa  747    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2930  starch synthase catalytic subunit  69.03 
 
 		 529 aa  754    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1252  starch synthase  100 
 
 		 535 aa  1100    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1325  starch synthase catalytic subunit  74.62 
 
 		 539 aa  810    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1172  starch synthase  51.96 
 
 		 549 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2161  starch synthase  49.65 
 
 		 571 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.705748  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2449  starch synthase  48.42 
 
 		 538 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0991  starch (glycogen) synthase  45.17 
 
 		 516 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.62314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.44 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  28.34 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.52 
 
 		 482 aa  156  9e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  28.92 
 
 		 492 aa  156  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.5 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  28.89 
 
 		 478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  28.62 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0346  glycogen/starch synthase ADP-glucose type  29.37 
 
 		 447 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  28.29 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.51 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.75 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  28.1 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  27.7 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.73 
 
 		 491 aa  149  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  27.41 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  27.86 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  28.83 
 
 		 484 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  29.7 
 
 		 499 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  28.36 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  26.32 
 
 		 485 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.24 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  27.86 
 
 		 479 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  27.9 
 
 		 479 aa  144  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  27.83 
 
 		 487 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  27.83 
 
 		 487 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.12 
 
 		 483 aa  143  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  29 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.78 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.23 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.69 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  28.47 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.47 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  28.47 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  28.47 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  28.47 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  28.47 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  28.47 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  27.82 
 
 		 533 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.19 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  26.4 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  28.47 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  27.24 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.01 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  28.28 
 
 		 513 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  26.5 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  27.86 
 
 		 477 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  26.69 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  28.92 
 
 		 477 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  27.14 
 
 		 480 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  26.73 
 
 		 476 aa  140  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  26.73 
 
 		 476 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.84 
 
 		 488 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  28.65 
 
 		 486 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  26.92 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  28.94 
 
 		 483 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  26.65 
 
 		 478 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.82 
 
 		 478 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  25.98 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  26.54 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  27.81 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  26.08 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  26.54 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  29.18 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  27.14 
 
 		 529 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  28.09 
 
 		 474 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  26.54 
 
 		 498 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  28.41 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0239  glycogen synthase  25.88 
 
 		 482 aa  139  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2803  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.62 
 
 		 500 aa  139  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0129152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  28.04 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  27.95 
 
 		 477 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.05 
 
 		 478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  27.19 
 
 		 465 aa  138  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003946  glycogen synthase ADP-glucose transglucosylase  26.39 
 
 		 485 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  28.1 
 
 		 477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  26.36 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.19 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06651  glycogen synthase  28.01 
 
 		 483 aa  137  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  27.48 
 
 		 476 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  27.48 
 
 		 476 aa  136  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  27.05 
 
 		 476 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  28.21 
 
 		 486 aa  136  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  28.28 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  28.28 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.3 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  28.28 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  28.28 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>