52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4055 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4055  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3365  hypothetical protein  52.46 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.75727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0697  domain of unknown function DUF1738  42.62 
 
 		 653 aa  148  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5209  hypothetical protein  40.34 
 
 		 267 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.767147  normal  0.342725 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6530  hypothetical protein  39.38 
 
 		 345 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5237  hypothetical protein  41.53 
 
 		 310 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1595  hypothetical protein  41.53 
 
 		 310 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6243  hypothetical protein  39.11 
 
 		 297 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5588  hypothetical protein  32.29 
 
 		 333 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2287  hypothetical protein  31.67 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1327  hypothetical protein  31.67 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0330254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1712  hypothetical protein  31.67 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2727  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  32.08 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000895401  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  27.55 
 
 		 520 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  27.55 
 
 		 520 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  31.13 
 
 		 527 aa  48.9  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  27.34 
 
 		 793 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 522 aa  49.3  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2550  type I restriction-modification system, M subunit  31.18 
 
 		 527 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.19461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3385  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.57 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  29.9 
 
 		 790 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  26.56 
 
 		 763 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  26.53 
 
 		 547 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  28.36 
 
 		 493 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  25.29 
 
 		 673 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  25.51 
 
 		 547 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  33.68 
 
 		 522 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  33.68 
 
 		 522 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  28.9 
 
 		 810 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  31.46 
 
 		 523 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  25.71 
 
 		 516 aa  45.1  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  28.57 
 
 		 516 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0332  N-6 DNA methylase  26.32 
 
 		 709 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  27.15 
 
 		 728 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  28.67 
 
 		 498 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  25.2 
 
 		 647 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2564  hypothetical protein  31.25 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000782255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  23.74 
 
 		 661 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  29.51 
 
 		 810 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  25.85 
 
 		 725 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.33 
 
 		 498 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  34.85 
 
 		 783 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  29.63 
 
 		 799 aa  42.4  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  31.48 
 
 		 799 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.81 
 
 		 496 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.64 
 
 		 644 aa  42.4  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  31.03 
 
 		 554 aa  41.6  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  32.86 
 
 		 505 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  27.42 
 
 		 658 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  32.2 
 
 		 505 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  32.86 
 
 		 504 aa  41.6  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  26.92 
 
 		 710 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>