44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2074 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2074  chorismate mutase  100 
 
 
176 aa  357  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3618  chorismate mutase  58.58 
 
 
176 aa  195  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3495  chorismate mutase  56.55 
 
 
176 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2624  chorismate mutase  47.65 
 
 
186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2709  chorismate mutase  47.65 
 
 
186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.749579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1584  chorismate mutase  47.65 
 
 
186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1325  chorismate mutase  41.82 
 
 
185 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.17523  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3009  chorismate mutase  39.51 
 
 
185 aa  134  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3147  chorismate mutase  42.11 
 
 
185 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.973197  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1896  chorismate mutase  39.77 
 
 
180 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1374  chorismate mutase  36.46 
 
 
181 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000188427  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1358  chorismate mutase  36.46 
 
 
181 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000159467  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2093  chorismate mutase  36.46 
 
 
181 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00333633  hitchhiker  0.000000577582 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1912  chorismate mutase  36.46 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1390  chorismate mutase  36.46 
 
 
181 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00284187  normal  0.322204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  37.12 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0678  chorismate mutase  32.84 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4115  chorismate mutase  34.23 
 
 
197 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000003876  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1007  chorismate mutase  34.48 
 
 
197 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000012767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0529  chorismate mutase  34.48 
 
 
197 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0728632  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0867  chorismate mutase  34.15 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00756442  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0967  chorismate mutase  34.48 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000119037  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0879  chorismate mutase  32.74 
 
 
197 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2391  chorismate mutase  36.21 
 
 
196 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3076  chorismate mutase  34.21 
 
 
198 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.359714  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0915  chorismate mutase  32.64 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1596  chorismate mutase  32.97 
 
 
202 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000122178  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3314  chorismate mutase  29.32 
 
 
199 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3544  chorismate mutase  36.19 
 
 
202 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3039  chorismate mutase  34.03 
 
 
205 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000151521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0480  chorismate mutase  34.03 
 
 
197 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.769814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0141  chorismate mutase  34.03 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3005  chorismate mutase  34.03 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148314  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1006  chorismate mutase  34.03 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2635  chorismate mutase  34.03 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11913  chorismate mutase  33.05 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2939  chorismate mutase  33.33 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000062955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2781  chorismate mutase  33.33 
 
 
188 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2737  chorismate mutase  33.33 
 
 
188 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0357  chorismate mutase  31.19 
 
 
185 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4818  chorismate mutase  30.28 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0483  chorismate mutase  28.7 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1673  chorismate mutase  36.9 
 
 
189 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337949  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1464  chorismate mutase  34.48 
 
 
185 aa  41.2  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.417933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>