34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3739 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  100 
 
 
415 aa  861    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2031  PGAP1 family protein  30.98 
 
 
442 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0194  hypothetical protein  32.76 
 
 
577 aa  64.3  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0942336  normal  0.647559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  30.28 
 
 
382 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  29.37 
 
 
254 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  24.11 
 
 
276 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  23.18 
 
 
247 aa  49.7  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  30.28 
 
 
222 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  30.09 
 
 
221 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  27.48 
 
 
313 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4256  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
310 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0134  PGAP1 family protein  24.85 
 
 
263 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.535724  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  33.75 
 
 
309 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  29.03 
 
 
281 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  27.34 
 
 
222 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  27.01 
 
 
223 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  24.78 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  27.27 
 
 
225 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.13 
 
 
562 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  25.18 
 
 
285 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  27.84 
 
 
364 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  25.89 
 
 
293 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  28.27 
 
 
216 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  24.48 
 
 
377 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  32.5 
 
 
393 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
256 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  29.23 
 
 
364 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  24.83 
 
 
299 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  26.52 
 
 
211 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  26.55 
 
 
360 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  26.55 
 
 
364 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  26.55 
 
 
360 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>