More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1748 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1748  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00373907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2346  ABC transporter-related protein  56.82 
 
 		 221 aa  251  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0523662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1793  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1544  ABC transporter related  52.47 
 
 		 225 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 236 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2802  ABC transporter related  54.21 
 
 		 225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1898  ABC transporter related  53.49 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1769  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  49.53 
 
 		 225 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0632527  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2484  ABC transporter related  51.4 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2744  ABC transporter related  47.72 
 
 		 233 aa  182  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.600258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1447  ABC transporter related  39.34 
 
 		 216 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1497  ABC transporter related  41.18 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3493  ABC transporter related  37.16 
 
 		 226 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  32.92 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  34.47 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.89 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.19 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  32.8 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  33.06 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  32.91 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  31.17 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  33.61 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1293  ATPase  35.94 
 
 		 234 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.38 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  31.25 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07851  putative phosphonate ABC transporter  33.47 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.09 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  32.8 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1184  ATPase  34.86 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.795417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  32.2 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0672  ATPase  29.37 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  27.7 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07291  putative phosphonate ABC transporter  31.17 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  33.46 
 
 		 354 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  29.76 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  33.19 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  33.19 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02560  ABC transporter  29.13 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0104  ATPase  32.87 
 
 		 244 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07251  putative phosphonate ABC transporter  29.76 
 
 		 246 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.17 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  31.08 
 
 		 499 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.35 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3919  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  31.42 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  31.8 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14301  putative phosphonate ABC transporter  33.2 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.3 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  32.02 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07451  putative phosphonate ABC transporter  29.22 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  30.4 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  28.2 
 
 		 498 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  29.57 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  31.98 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  30.2 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.2 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  29.69 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  30.47 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0377  ABC transporter related  29.02 
 
 		 261 aa  92.4  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.308685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  29.65 
 
 		 259 aa  92  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0874  ABC transporter-like protein  29.49 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.3 
 
 		 270 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.06 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  27.82 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.29 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.9 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  29.28 
 
 		 498 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  29.06 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  28.06 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  27.78 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.3 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  27.38 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1420  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.48 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  28.06 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  30.84 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  28.92 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.57 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.94 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  29.76 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  29.69 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  32.49 
 
 		 253 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  27.2 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  27.2 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.43 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  27.2 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  27.4 
 
 		 279 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  27.2 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.43 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  27.4 
 
 		 279 aa  89.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  29.01 
 
 		 277 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 307 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3862  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.43 
 
 		 282 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 307 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  30.7 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.75 
 
 		 279 aa  88.6  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.75 
 
 		 281 aa  88.6  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.75 
 
 		 279 aa  88.6  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>