80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6365 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  260  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  40.41 
 
 
148 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  36.11 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  36.3 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  36.3 
 
 
148 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  37.5 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  37.59 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  35.92 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  33.56 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  32.19 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  34.03 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  32.14 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  38.79 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  34.03 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  31.75 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  33.57 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  32.62 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  36.56 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  33.59 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  33.86 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  31.65 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  27.74 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  38.46 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  37.1 
 
 
180 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  29.03 
 
 
167 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  32.89 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  32.21 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  32.21 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  29.37 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  32.8 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  32.26 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  32.26 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  32.21 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  28.57 
 
 
159 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  28.8 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  28.28 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  25.2 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  30.28 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  29.77 
 
 
297 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  26.45 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  26.71 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  28 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  28 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  31.58 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  30.61 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  29.03 
 
 
279 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  27.62 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  29.55 
 
 
352 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  28.67 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  32.69 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  27.66 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  29.7 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  27.5 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  29.7 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  29.7 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  35.48 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  25.87 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  25.71 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  31.58 
 
 
343 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  28.1 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  26.35 
 
 
146 aa  42  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  31.53 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  26.71 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  26.71 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  30.53 
 
 
289 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  30.61 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  27.69 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  29 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  29 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  26.88 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  29 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  30.53 
 
 
343 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.77 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  24 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  31.48 
 
 
343 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  31.48 
 
 
343 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  31.48 
 
 
343 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>