48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5758 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5758  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0340  xylose isomerase domain-containing protein  69.53 
 
 		 302 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0407  xylose isomerase domain-containing protein  69.14 
 
 		 295 aa  362  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  58.27 
 
 		 288 aa  305  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  58.27 
 
 		 308 aa  304  8.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  58.04 
 
 		 272 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  55.04 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  53.91 
 
 		 305 aa  279  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  52.73 
 
 		 312 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.3 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.26 
 
 		 268 aa  268  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  52.36 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  54.61 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  54.72 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  51.17 
 
 		 262 aa  258  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.64 
 
 		 305 aa  254  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.92 
 
 		 295 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  53.33 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  49.27 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  49.27 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.52 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  47.45 
 
 		 278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0666  xylose isomerase-like TIM barrel  47.45 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0679  xylose isomerase domain-containing protein  47.45 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0659  xylose isomerase domain-containing protein  47.45 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  48.55 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  48.06 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.73 
 
 		 284 aa  227  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  47.66 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18060  sugar phosphate isomerase/epimerase  46.54 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24530  sugar phosphate isomerase/epimerase  48.45 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  24.73 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  24.55 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  25.44 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  29.59 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.9 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000134824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1512  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.9 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.87 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  37.5 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  20.73 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  34.29 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  20.73 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  20.73 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  20.73 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  20.73 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  20.9 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.73 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  20.73 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>