More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5384 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  68.38 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4673  transcriptional regulator, MerR family  74.07 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156077  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  61.9 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  63.83 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  47.76 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  45.65 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  43.28 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  47.41 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  36.91 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.2 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.16 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.23 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  45.92 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.39 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  45 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  38.46 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  37.5 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  36.43 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  37.69 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  35.66 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  38.52 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  38.35 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  39.23 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  38.52 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  37.69 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  37.69 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  37.69 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  37.69 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  36.84 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  37.04 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  37.69 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  37.69 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  37.84 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  39.23 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  38.26 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  36.52 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2198  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  36.43 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  36.92 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  34.03 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  34.43 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  37.98 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.07 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  34.67 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  34.75 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  34.75 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  34.86 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.61 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  36.97 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  35.43 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.61 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.61 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  36.97 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  35.82 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  31.5 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  34.86 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 172 aa  70.1  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  36.21 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  36.52 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>