56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5274 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5274  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  100 
 
 		 224 aa  470  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  50.45 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35340  negative regulator of beta-lactamase expression  47.96 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  50.28 
 
 		 391 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  51.72 
 
 		 375 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  44.7 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  45.37 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  45.02 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.3 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  43.98 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  41.2 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.32 
 
 		 356 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  42.29 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16840  hypothetical protein  39.56 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.11 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.65 
 
 		 784 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.2 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.123006  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5009  hypothetical protein  39.81 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.06 
 
 		 959 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.49 
 
 		 879 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1023  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.27 
 
 		 636 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1669  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.22 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.761458  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.91 
 
 		 591 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0529  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase, putative  28.85 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.549299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28 
 
 		 905 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0545  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.29 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  26.7 
 
 		 654 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3764  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.89 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0204504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  27.75 
 
 		 928 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.49 
 
 		 552 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0455  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.38 
 
 		 357 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  30.3 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1972  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  24.86 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  24.38 
 
 		 695 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.21 
 
 		 728 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1539  twin-arginine translocation pathway signal  25.67 
 
 		 486 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.407284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.5 
 
 		 366 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0021339  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3745  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.74 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.48 
 
 		 694 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0270  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.96 
 
 		 364 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  26.11 
 
 		 541 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.01 
 
 		 964 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3323  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.74 
 
 		 150 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3698  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.06 
 
 		 150 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.06 
 
 		 150 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.17 
 
 		 157 aa  45.1  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0196  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.04 
 
 		 502 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.2 
 
 		 950 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.56 
 
 		 1072 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.54 
 
 		 964 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1572  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.1 
 
 		 150 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.577314  normal  0.236623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3670  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.76 
 
 		 152 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0492519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3666  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  26.76 
 
 		 150 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3648  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.06 
 
 		 150 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1862  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.54 
 
 		 219 aa  42  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.108984 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3389  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.06 
 
 		 152 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0561834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>