60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2119 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  340  5.999999999999999e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  67.66 
 
 
165 aa  221  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  67.47 
 
 
165 aa  218  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  48.67 
 
 
162 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  39.1 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  40.97 
 
 
405 aa  91.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1135  hypothetical protein  41.01 
 
 
304 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  35 
 
 
186 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  39.72 
 
 
170 aa  87.4  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  32.17 
 
 
154 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  36.43 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  33.54 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1275  H+-ATPase subunit H  31.94 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000867446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  31.21 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  48.39 
 
 
245 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  29.79 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  46.24 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  45.16 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  30.4 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  45.16 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  45.16 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  45.16 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  39.04 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  44.94 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  29.38 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  27.66 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  31.94 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  30.92 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  29.82 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  43.82 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  28.04 
 
 
229 aa  64.7  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  31.97 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  29.92 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  30.72 
 
 
222 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  28.99 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  26.67 
 
 
153 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  26.76 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  27.67 
 
 
177 aa  61.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  60.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  29.6 
 
 
176 aa  60.8  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  30.67 
 
 
311 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1357  hypothetical protein  28.33 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  normal  0.328622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  31.39 
 
 
152 aa  58.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2296  hypothetical protein  40.56 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0824729  hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  27.03 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0937  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  30.71 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221093  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1038  hypothetical protein  28.38 
 
 
296 aa  53.9  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  25 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10030  hypothetical protein  25.85 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000144156  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4032  large Ala/Glu-rich protein  39.58 
 
 
229 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  29.73 
 
 
165 aa  51.2  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  22.78 
 
 
231 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  22.78 
 
 
231 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  26.71 
 
 
139 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  26.51 
 
 
339 aa  48.5  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1806  hypothetical protein  26.15 
 
 
125 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  25.53 
 
 
310 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0902  hypothetical protein  21.29 
 
 
181 aa  42.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  22.45 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>