26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0539 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1317    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  38.36 
 
 		 563 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  33.66 
 
 		 788 aa  263  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  34.43 
 
 		 791 aa  256  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  32.89 
 
 		 839 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  31.85 
 
 		 1011 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  29.15 
 
 		 801 aa  180  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  29.74 
 
 		 722 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  26.04 
 
 		 965 aa  154  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  29.33 
 
 		 580 aa  153  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  26.46 
 
 		 951 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  24.96 
 
 		 832 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  23.99 
 
 		 627 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  23.9 
 
 		 838 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  31.32 
 
 		 1049 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1121 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  25.57 
 
 		 709 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  24.96 
 
 		 708 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.18 
 
 		 644 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.31 
 
 		 789 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  26.2 
 
 		 2286 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  22.26 
 
 		 677 aa  67.4  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1024 aa  55.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  42.31 
 
 		 689 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  22.22 
 
 		 1236 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2350  hypothetical protein  31.39 
 
 		 473 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>