More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1089 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
334 aa  672    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0172  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.91 
 
 
339 aa  425  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.719394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 
336 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 
336 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2515  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 
333 aa  376  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.75499  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.61 
 
 
349 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 
349 aa  371  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.53 
 
 
338 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  57.74 
 
 
349 aa  371  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.63 
 
 
345 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 
335 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.82 
 
 
338 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 
336 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  53.33 
 
 
341 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 
338 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
333 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
333 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
336 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
336 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
336 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.4 
 
 
541 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.71 
 
 
343 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.71 
 
 
343 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0152  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 
347 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00761409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.5 
 
 
340 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
333 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.81 
 
 
346 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.69 
 
 
334 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
333 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 
351 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.72 
 
 
333 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 
343 aa  363  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.31 
 
 
333 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
333 aa  363  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.4 
 
 
342 aa  363  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 
344 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
335 aa  363  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.4 
 
 
333 aa  362  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.12 
 
 
330 aa  362  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.36 
 
 
346 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 
355 aa  362  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.49 
 
 
338 aa  362  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.34 
 
 
337 aa  361  9e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.37 
 
 
336 aa  361  9e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 
333 aa  361  9e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.36 
 
 
346 aa  360  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.41 
 
 
339 aa  360  1e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.03 
 
 
344 aa  360  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.69 
 
 
343 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 
338 aa  360  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 
336 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 
363 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.02 
 
 
334 aa  359  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.99 
 
 
339 aa  359  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  53.72 
 
 
336 aa  358  6e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 
336 aa  358  6e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 
336 aa  358  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 
336 aa  358  6e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 
336 aa  358  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 
336 aa  358  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  53.72 
 
 
336 aa  358  6e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 
334 aa  358  7e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 
347 aa  358  7e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.02 
 
 
334 aa  358  8e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 
347 aa  358  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 
334 aa  358  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 
336 aa  358  9e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 
334 aa  358  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.15 
 
 
351 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 
358 aa  357  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.69 
 
 
338 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 
338 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.15 
 
 
351 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.34 
 
 
357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.4 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.05 
 
 
334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 
366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 
352 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.34 
 
 
357 aa  355  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  55.02 
 
 
342 aa  355  5e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.72 
 
 
336 aa  355  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.34 
 
 
357 aa  355  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.4 
 
 
336 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.69 
 
 
354 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.4 
 
 
336 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.55 
 
 
355 aa  355  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.34 
 
 
356 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  54.34 
 
 
346 aa  355  6.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.69 
 
 
336 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 
337 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1909  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
318 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0928672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.02 
 
 
334 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.02 
 
 
345 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 
354 aa  355  7.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.34 
 
 
334 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 
335 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 
352 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.7 
 
 
336 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>