291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4228 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  74.96 
 
 		 568 aa  788    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4228  dihydroxyacetone kinase  100 
 
 		 572 aa  1114    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  59.15 
 
 		 569 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  55.02 
 
 		 616 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  54.66 
 
 		 581 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  53.78 
 
 		 581 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  53.78 
 
 		 581 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  51.9 
 
 		 581 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  52.47 
 
 		 587 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3953  dihydroxyacetone kinase  52.86 
 
 		 587 aa  488  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  53.15 
 
 		 571 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29810  dihydroxyacetone kinase  51.65 
 
 		 578 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2647  dihydroxyacetone kinase  52.76 
 
 		 567 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4222  Glycerone kinase  51.58 
 
 		 576 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0184  Glycerone kinase  51.77 
 
 		 612 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000456785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1547  dihydroxyacetone kinase  54.73 
 
 		 585 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.462978  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  47.34 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  60.54 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  57.14 
 
 		 335 aa  356  5e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  33.1 
 
 		 582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  36.02 
 
 		 598 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  32.99 
 
 		 583 aa  287  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  32.99 
 
 		 583 aa  287  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  32.65 
 
 		 583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  32.93 
 
 		 583 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  32.99 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  33.16 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  32.82 
 
 		 583 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  32.99 
 
 		 583 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  32.82 
 
 		 583 aa  279  9e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  32.99 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  32.24 
 
 		 583 aa  273  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  35.32 
 
 		 588 aa  263  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 		 589 aa  260  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  48.41 
 
 		 334 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  38.55 
 
 		 570 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  47 
 
 		 334 aa  253  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  36.14 
 
 		 567 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  38.55 
 
 		 570 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  38.81 
 
 		 544 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  37.21 
 
 		 566 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  38.65 
 
 		 616 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  38.55 
 
 		 570 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  38.42 
 
 		 544 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  38.42 
 
 		 544 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  36.05 
 
 		 566 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  34.2 
 
 		 580 aa  248  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  35.92 
 
 		 546 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  44.74 
 
 		 333 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  33.52 
 
 		 612 aa  243  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.23 
 
 		 332 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  35.83 
 
 		 569 aa  239  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  36.67 
 
 		 569 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  36.67 
 
 		 569 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  38.31 
 
 		 616 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3761  Dak kinase  42.33 
 
 		 327 aa  238  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  36.95 
 
 		 572 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  33.45 
 
 		 544 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  36.39 
 
 		 335 aa  233  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  35.82 
 
 		 560 aa  232  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  31.69 
 
 		 577 aa  231  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  43.01 
 
 		 700 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  40.9 
 
 		 333 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  37.46 
 
 		 694 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.41 
 
 		 329 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.91 
 
 		 331 aa  226  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  41.12 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  39.35 
 
 		 334 aa  225  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  34.29 
 
 		 572 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  36.7 
 
 		 567 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  35.51 
 
 		 567 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  38.7 
 
 		 333 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.99 
 
 		 332 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.94 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  37.08 
 
 		 695 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  38.07 
 
 		 694 aa  222  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.44 
 
 		 333 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.14 
 
 		 332 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  40 
 
 		 332 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.99 
 
 		 332 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4584  Glycerone kinase  34.03 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  35.61 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2889  Glycerone kinase  39.44 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  36.5 
 
 		 334 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0356  Glycerone kinase  44.19 
 
 		 330 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  36.67 
 
 		 331 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.44 
 
 		 330 aa  217  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.24 
 
 		 333 aa  217  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  40.55 
 
 		 331 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3286  dihydroxyacetone kinase family protein  38.96 
 
 		 333 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0949  dihydroxyacetone kinase family protein  39.57 
 
 		 362 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.181047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2167  Glycerone kinase  35.18 
 
 		 544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3419  Glycerone kinase  39.57 
 
 		 362 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0658381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.53 
 
 		 331 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00034  dihydroxyacetone kinase (Eurofung)  32.66 
 
 		 590 aa  213  5.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.160552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  37.5 
 
 		 333 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0620  Glycerone kinase  45.06 
 
 		 336 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3211  Glycerone kinase  38.55 
 
 		 332 aa  213  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22060  Glycerone kinase  37.8 
 
 		 333 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.75 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>